RNA–Protein interactions for RNA: YKR087C

OMA1, Transcript of Metalloendopeptidase of the mitochondrial inner membrane, yeast

Gene OMA1, Length 1,038 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
OMA1	YKR087C	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
OMA1	YKR087C	SEC62	P21825	274 aa		4.75	□□□□□ -1.65
OMA1	YKR087C	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
OMA1	YKR087C	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
OMA1	YKR087C	GUF1	P46943	645 aa		4.75	□□□□□ -1.65
OMA1	YKR087C	DSD1	P53095	428 aa		4.75	□□□□□ -1.65
OMA1	YKR087C	YGR126W	P53274	230 aa		4.75	□□□□□ -1.65
OMA1	YKR087C	SAM50	P53969	484 aa		4.75	□□□□□ -1.65
OMA1	YKR087C	SDH5	Q08230	162 aa		4.75	□□□□□ -1.65
OMA1	YKR087C	NMD4	Q12129	218 aa		4.75	□□□□□ -1.65
OMA1	YKR087C	PMS1	P14242	873 aa		4.74	□□□□□ -1.65
OMA1	YKR087C	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
OMA1	YKR087C	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
OMA1	YKR087C	VPS17	P32913	551 aa		4.74	□□□□□ -1.65
OMA1	YKR087C	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
OMA1	YKR087C	FLC2	P39719	783 aa		4.74	□□□□□ -1.65
OMA1	YKR087C	RBA50	Q04418	439 aa		4.74	□□□□□ -1.65
OMA1	YKR087C	YEH1	Q07804	573 aa		4.74	□□□□□ -1.65
OMA1	YKR087C	MRP13	P12686	339 aa		4.73	□□□□□ -1.65
OMA1	YKR087C	PEP5	P12868	1029 aa		4.73	□□□□□ -1.65
OMA1	YKR087C	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
OMA1	YKR087C	SEF1	P34228	1148 aa		4.73	□□□□□ -1.65
OMA1	YKR087C	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
OMA1	YKR087C	CIN4	P39110	191 aa		4.73	□□□□□ -1.65
OMA1	YKR087C	ALG5	P40350	334 aa		4.73	□□□□□ -1.65
OMA1	YKR087C	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
OMA1	YKR087C	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
OMA1	YKR087C	VID30	P53076	958 aa		4.73	□□□□□ -1.65
OMA1	YKR087C	MSC1	Q03104	513 aa		4.73	□□□□□ -1.65
OMA1	YKR087C	YDL121C	Q07541	149 aa		4.73	□□□□□ -1.65
OMA1	YKR087C	RCN2	Q12044	265 aa		4.73	□□□□□ -1.65
OMA1	YKR087C	YPT6	Q99260	215 aa		4.73	□□□□□ -1.65
OMA1	YKR087C	SGF29	P25554	259 aa		4.72	□□□□□ -1.65
OMA1	YKR087C	REG2	P38232	338 aa		4.72	□□□□□ -1.65
OMA1	YKR087C	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
OMA1	YKR087C	IKS1	P47042	667 aa		4.72	□□□□□ -1.65
OMA1	YKR087C	BUD32	P53323	261 aa		4.72	□□□□□ -1.65
OMA1	YKR087C	RHO4	Q00246	291 aa		4.72	□□□□□ -1.65
OMA1	YKR087C	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
OMA1	YKR087C	ECM15	P35195	104 aa		4.71	□□□□□ -1.66
OMA1	YKR087C	THI20	Q08224	551 aa		4.71	□□□□□ -1.66
OMA1	YKR087C	CTI6	Q08923	506 aa		4.71	□□□□□ -1.66
OMA1	YKR087C	PHO2	P07269	559 aa		4.7	□□□□□ -1.66
OMA1	YKR087C	CCT6	P39079	546 aa		4.7	□□□□□ -1.66
OMA1	YKR087C	YTA12	P40341	825 aa		4.7	□□□□□ -1.66
OMA1	YKR087C	MRX6	P48564	524 aa		4.7	□□□□□ -1.66
OMA1	YKR087C	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
OMA1	YKR087C	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		4.7	□□□□□ -1.66
OMA1	YKR087C	CBS1	P14066	229 aa		4.69	□□□□□ -1.66
OMA1	YKR087C	APE1	P14904	514 aa		4.69	□□□□□ -1.66
OMA1	YKR087C	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
OMA1	YKR087C	YMR087W	Q04299	284 aa		4.69	□□□□□ -1.66
OMA1	YKR087C	VPS38	Q05919	439 aa		4.69	□□□□□ -1.66
OMA1	YKR087C	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		4.69	□□□□□ -1.66
OMA1	YKR087C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
OMA1	YKR087C	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
OMA1	YKR087C	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
OMA1	YKR087C	CSM2	P40465	213 aa		4.68	□□□□□ -1.66
OMA1	YKR087C	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.68	□□□□□ -1.66	not detected
OMA1	YKR087C	ALT2	P52892	507 aa		4.68	□□□□□ -1.66
OMA1	YKR087C	TOF2	Q02208	771 aa		4.68	□□□□□ -1.66
OMA1	YKR087C	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
OMA1	YKR087C	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
OMA1	YKR087C	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.68	□□□□□ -1.66	not detected
OMA1	YKR087C	GAL80	P04387	435 aa		4.67	□□□□□ -1.66
OMA1	YKR087C	MRS3	P10566	314 aa		4.67	□□□□□ -1.66
OMA1	YKR087C	PTR2	P32901	601 aa		4.67	□□□□□ -1.66
OMA1	YKR087C	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
OMA1	YKR087C	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
OMA1	YKR087C	MSR1	P38714	643 aa		4.67	□□□□□ -1.66
OMA1	YKR087C	YHR210C	P38893	341 aa		4.67	□□□□□ -1.66
OMA1	YKR087C	YGR066C	P53242	292 aa		4.67	□□□□□ -1.66
OMA1	YKR087C	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
OMA1	YKR087C	COQ9	Q05779	260 aa		4.67	□□□□□ -1.66
OMA1	YKR087C	THP1	Q08231	455 aa		4.67	□□□□□ -1.66
OMA1	YKR087C	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
OMA1	YKR087C	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
OMA1	YKR087C	NDC1	P32500	655 aa		4.66	□□□□□ -1.66
OMA1	YKR087C	YME1	P32795	747 aa		4.66	□□□□□ -1.66
OMA1	YKR087C	SHP1	P34223	423 aa		4.66	□□□□□ -1.66
OMA1	YKR087C	VPS52	P39904	641 aa		4.66	□□□□□ -1.66
OMA1	YKR087C	DOT5	P40553	215 aa		4.66	□□□□□ -1.66
OMA1	YKR087C	RMD8	P43620	662 aa		4.66	□□□□□ -1.66
OMA1	YKR087C	YJR154W	P47181	346 aa		4.66	□□□□□ -1.66
OMA1	YKR087C	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
OMA1	YKR087C	RLM1	Q12224	676 aa		4.66	□□□□□ -1.66
OMA1	YKR087C	GCN4	P03069	281 aa		4.65	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	TOP1	P04786	769 aa		4.65	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	MDM31	P38880	579 aa		4.65	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	VPS75	P53853	264 aa		4.65	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	RTT103	Q05543	409 aa		4.65	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	AVL9	Q12500	764 aa		4.65	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	RGT1	P32862	1170 aa		4.64	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	SRO77	P38163	1010 aa		4.64	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.6 ms