RNA–Protein interactions for RNA: YJL028W

YJL028W, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YJL028W, Length 336 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJL028W	YJL028W	AIM22	P47051	409 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	YGR111W	P53265	400 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	SLI1	P53304	468 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	RSM23	Q01163	450 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	YMR160W	Q03823	816 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	MMR1	Q06324	491 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	SIL1	Q08199	421 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	FRE3	Q08905	711 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	CLB2	P24869	491 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	YIM1	P28625	365 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	HEL1	P36113	551 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	SLM4	P38247	162 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	YHR054C	P38780	354 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	MRK1	P50873	501 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	TOF2	Q02208	771 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	YPL107W	Q02873	248 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.14	□□□□□ -1.75	not detected
YJL028W	YJL028W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	SKS1	Q12505	502 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	RPN13	O13563	156 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	CYB2	P00175	591 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	ARG81	P05085	880 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	PUT2	P07275	575 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	GAC1	P28006	793 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	MSS51	P32335	436 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	LTV1	P34078	463 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	OCT1	P35999	772 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	MIA40	P36046	403 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	ORC5	P50874	479 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	ASI1	P54074	624 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	CTF4	Q01454	927 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	PDR8	Q06149	701 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	CDC45	Q08032	650 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	MCH4	Q08268	501 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	UAF30	Q08747	228 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.13	□□□□□ -1.75	not detected
YJL028W	YJL028W	HIP1	P06775	603 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	NUP1	P20676	1076 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	NIP100	P33420	868 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	PIM1	P36775	1133 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	PAC2	P39937	518 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	SER3	P40054	469 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	ATG27	P46989	271 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	YGL138C	P53122	345 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	YGR126W	P53274	230 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	EOS1	P53938	366 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	SKO1	Q02100	647 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	HOT1	Q03213	719 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	PIG1	Q06216	648 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	ATG26	Q06321	1198 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	YDL057W	Q07379	328 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	DCI1	Q08558	271 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	VPS54	Q12071	889 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	SUT2	Q12286	268 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	CBP1	P07252	654 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	COR1	P07256	457 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	DAL5	P15365	543 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.11	□□□□□ -1.75	not detected
YJL028W	YJL028W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	ARN1	P38731	627 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	POP2	P39008	433 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	PES4	P39684	611 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	COS5	P47187	383 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	YGR149W	P48236	432 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	FMS1	P50264	508 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	YGL108C	P53139	140 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	YNL144C	P53907	740 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	SLG1	P54867	378 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	FMP30	Q02883	468 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	ACL4	Q03771	387 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	BSP1	Q06604	576 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	COS7	Q07788	383 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.11	□□□□□ -1.75	not detected
YJL028W	YJL028W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	YLR111W	Q12528	110 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	RAD14	P28519	371 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	AFG1	P32317	509 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	SWH1	P35845	1188 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	APD1	P38281	316 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	UBA4	P38820	440 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.5 ms