RNA–Protein interactions for RNA: YGL227W

VID30, Transcript of Central component of GID Complex, involved in FBPase degradation, yeast

Gene VID30, Length 2,877 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VID30	YGL227W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
VID30	YGL227W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
VID30	YGL227W	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
VID30	YGL227W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
VID30	YGL227W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
VID30	YGL227W	SSN3	P39073	555 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VID30	YGL227W	SEO1	P39709	593 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VID30	YGL227W	YER189W	P40104	122 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VID30	YGL227W	RGI2	P40188	164 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VID30	YGL227W	GTS1	P40956	396 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VID30	YGL227W	YML6	P51998	286 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VID30	YGL227W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
VID30	YGL227W	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
VID30	YGL227W	STP3	Q05937	343 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VID30	YGL227W	SCM3	Q12334	223 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VID30	YGL227W	AAC3	P18238	307 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VID30	YGL227W	IMG1	P25626	169 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VID30	YGL227W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VID30	YGL227W	RCF2	P53721	224 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VID30	YGL227W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VID30	YGL227W	KCS1	Q12494	1050 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VID30	YGL227W	FAB1	P34756	2278 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VID30	YGL227W	BAS1	P22035	811 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VID30	YGL227W	PTP2	P29461	750 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VID30	YGL227W	RIB7	P33312	244 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VID30	YGL227W	SKN1	P33336	771 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VID30	YGL227W	CKB2	P38930	258 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VID30	YGL227W	KAP114	P53067	1004 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VID30	YGL227W	RKM2	Q03942	479 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VID30	YGL227W	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VID30	YGL227W	OCA6	Q12454	224 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VID30	YGL227W	MDM12	Q92328	271 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VID30	YGL227W	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VID30	YGL227W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	YEL043W	P32618	956 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	SCD5	P34758	872 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	YEL020C	P39994	560 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	TOK1	P40310	691 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	SPG5	P42933	373 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	STR2	P47164	639 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	GND2	P53319	492 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	HXT15	P54854	567 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	NUP100	Q02629	959 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	UGO1	Q03327	502 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	YCS4	Q06156	1176 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	VTA1	Q06263	330 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	AFI1	Q99222	893 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	TUP1	P16649	713 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	CLB1	P24868	471 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	PSO2	P30620	661 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	ERG3	P32353	365 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	VHC1	P38329	1120 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	AGX1	P43567	385 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	SAP4	P53036	818 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	YSA1	Q01976	231 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	SIZ1	Q04195	904 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	PUN1	Q06991	263 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	ATG9	Q12142	997 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	GCR1	P07261	785 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	CWH43	P25618	953 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	MRE11	P32829	692 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	QRI7	P43122	407 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	BRO1	P48582	844 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	RPN14	P53196	417 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	YLL054C	Q12244	843 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	RKM5	Q12367	367 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	ISN1	Q99312	450 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	CDC9	P04819	755 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	VPS34	P22543	875 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	YMC1	P32331	307 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	NPL6	P32832	435 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	SPC29	P33419	253 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	YET1	P35723	206 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	EMC3	P36039	253 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	YEL075C	P39972	122 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	YIL166C	P40445	542 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	MAL13	P53338	473 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	HNT3	Q08702	217 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	URA4	P20051	364 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	YBR197C	P38306	217 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	ERG5	P54781	538 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	YPR097W	Q06839	1073 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
VID30	YGL227W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	TOP3	P13099	656 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	MRP21	P38175	177 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	POP2	P39008	433 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VID30	YGL227W	AXL1	P40851	1208 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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