RNA–Protein interactions for RNA: YGL058W

RAD6, Transcript of Ubiquitin-conjugating enzyme (E2), yeast

Gene RAD6, Length 519 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RAD6	YGL058W	ALG5	P40350	334 aa		2.62	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	SPO22	P40511	975 aa		2.62	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	GUF1	P46943	645 aa		2.62	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	FIN1	Q03898	291 aa		2.62	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	FMP42	Q04991	504 aa		2.62	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	YLR352W	Q06479	807 aa		2.62	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	2.62	□□□□□ -1.99	not detected
RAD6	YGL058W	ARP6	Q12509	438 aa		2.62	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	ELO2	P25358	347 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	PEP3	P27801	918 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	RAD24	P32641	659 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	UBP11	P36026	717 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	ROT2	P38138	954 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	MUM2	P38236	366 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	YHR210C	P38893	341 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	ERP2	P39704	215 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	YIR014W	P40570	242 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	MET28	P40573	187 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	SNG1	P46950	547 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	AIM22	P47051	409 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	YGR126W	P53274	230 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	DUG3	P53871	357 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	IPI3	P53877	555 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	RHO4	Q00246	291 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	YPL014W	Q02606	381 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	SMA1	Q02651	245 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	COQ9	Q05779	260 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	DIC1	Q06143	298 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	SSK1	Q07084	712 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	YOR365C	Q08844	703 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	AVL9	Q12500	764 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	RTP1	Q12751	981 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	GAL80	P04387	435 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	ARG3	P05150	338 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	BAR1	P12630	587 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	PMS1	P14242	873 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	CDC23	P16522	626 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	MRE11	P32829	692 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	MIC60	P36112	540 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	AZF1	P41696	914 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	RMD8	P43620	662 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	ATG27	P46989	271 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	PET130	P47065	347 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	YJR154W	P47181	346 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	BUD32	P53323	261 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	MDM1	Q01846	1127 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	MSS11	Q03825	758 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	VPS38	Q05919	439 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	FMP45	Q07651	309 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	PEP5	P12868	1029 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	GLN3	P18494	730 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	ACH1	P32316	526 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	BZZ1	P38822	633 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	MET18	P40469	1032 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	AXL1	P40851	1208 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	MEP2	P41948	499 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	ALT2	P52892	507 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	CUL3	P53202	744 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	SHR3	Q02774	210 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	GRS2	Q06817	618 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	YDL057W	Q07379	328 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	CDC45	Q08032	650 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	THI20	Q08224	551 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	TAH18	Q12181	623 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RAD6	YGL058W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
RAD6	YGL058W	ROX1	P25042	368 aa		2.58	□□□□□ -2
RAD6	YGL058W	ECM15	P35195	104 aa		2.58	□□□□□ -2
RAD6	YGL058W	CST26	P38226	397 aa		2.58	□□□□□ -2
RAD6	YGL058W	MSR1	P38714	643 aa		2.58	□□□□□ -2
RAD6	YGL058W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
RAD6	YGL058W	YTA12	P40341	825 aa		2.58	□□□□□ -2
RAD6	YGL058W	DOT5	P40553	215 aa		2.58	□□□□□ -2
RAD6	YGL058W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	2.58	□□□□□ -2	not detected
RAD6	YGL058W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
RAD6	YGL058W	JJJ1	P53863	590 aa		2.58	□□□□□ -2
RAD6	YGL058W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
RAD6	YGL058W	SAM50	P53969	484 aa		2.58	□□□□□ -2
RAD6	YGL058W	TOF2	Q02208	771 aa		2.58	□□□□□ -2
RAD6	YGL058W	TAF11	Q04226	346 aa		2.58	□□□□□ -2
RAD6	YGL058W	YMR087W	Q04299	284 aa		2.58	□□□□□ -2
RAD6	YGL058W	RBA50	Q04418	439 aa		2.58	□□□□□ -2

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