RNA–Protein interactions for RNA: YGL009C

LEU1, Transcript of Isopropylmalate isomerase, yeast

Gene LEU1, Length 2,340 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LEU1	YGL009C	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	CAB2	P40506	365 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	NET1	P47035	1189 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	YMR102C	Q03177	834 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	MSC2	Q03455	724 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	SIZ1	Q04195	904 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	YDL144C	Q07589	356 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	NMD4	Q12129	218 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	NBP2	Q12163	236 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	TIP41	Q12199	356 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	COX17	Q12287	69 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	YML002W	P0CF17	737 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.71	□□□□□ -1.66	not detected
LEU1	YGL009C	ERV1	P27882	189 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	VPH2	P32341	215 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	CSE1	P33307	960 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	YHR078W	P38799	552 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	SDP1	P40479	209 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	GSM1	P42950	618 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	MRK1	P50873	501 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	MRPL1	Q04599	285 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	YLR455W	Q06188	304 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	CUR1	Q06469	252 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	SIL1	Q08199	421 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	CTI6	Q08923	506 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	HUA2	Q12134	243 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	ACF2	Q12168	779 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	UTR1	P21373	530 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	PRE4	P30657	266 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	YME2	P32843	850 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	GLG1	P36143	616 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	RFC5	P38251	354 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	YEL057C	P39983	233 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	NDC80	P40460	691 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	OTU1	P43558	301 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	TAH11	P47112	604 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	INP52	P50942	1183 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	RCO1	Q04779	684 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	VPS38	Q05919	439 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	ADY4	Q05955	493 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	SKG3	Q06315	1026 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	YEH2	Q07950	538 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	RAD61	Q99359	647 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	HMG2	P12684	1045 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	MRPL10	P36520	322 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	YER085C	P40058	173 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	PHB1	P40961	287 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	MAK10	Q02197	733 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	IRC4	Q03036	179 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	NGL3	Q03210	505 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	PPN1	Q04119	674 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	YLR173W	Q06247	608 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	YFT2	Q06676	274 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	UBX3	Q12229	455 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	GIT1	P25346	518 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	MAC1	P35192	417 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	THI2	P38141	450 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	BMT2	P38278	337 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	TCD1	P38756	429 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	WSS1	P38838	269 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	ICE2	P40499	491 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	VAM6	Q07468	1049 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	SWT1	Q12104	458 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	YOR111W	Q99210	232 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	GPA1	P08539	472 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	STE12	P13574	688 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	GID7	P25569	745 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	APL1	P27351	700 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	VPS51	P36116	164 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	BZZ1	P38822	633 aa		4.69	□□□□□ -1.66

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