RNA–Protein interactions for RNA: YER068W

MOT2, Transcript of Ubiquitin-protein ligase subunit of the CCR4-NOT complex, yeast

Gene MOT2, Length 1,764 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MOT2	YER068W	YEL057C	P39983	233 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	MET28	P40573	187 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	PRY1	P47032	299 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	INN1	P53901	409 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	ORC3	P54790	616 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	AIM32	Q04689	311 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	COA4	Q05809	96 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	STE23	Q06010	1027 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	YLR177W	Q06251	628 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	SKG3	Q06315	1026 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	ARR3	Q06598	404 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	BPT1	P14772	1559 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	PSK1	P31374	1356 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	STF1	P01098	86 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	GPA2	P10823	449 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	REC107	P21651	314 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	VPS3	P23643	1011 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	RDS1	P25611	832 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	COQ2	P32378	372 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	DSS4	P32601	143 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	STP2	P38704	541 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	TDA11	P38854	504 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	YIL077C	P40508	320 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	GOR1	P53839	350 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	USA1	Q03714	838 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	TCO89	Q08921	799 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	SWT1	Q12104	458 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	NPC2	Q12408	173 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	LAM4	P38800	1345 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	STE3	P06783	470 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	RAP1	P11938	827 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	YCR015C	P25616	317 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	YJL206C	P39529	758 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	JLP2	P40206	208 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	LCB2	P40970	561 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	SAE2	P46946	345 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	SWP1	Q02795	286 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	OAZ1	Q02803	292 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	HOF1	Q05080	669 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	DXO1	Q06349	442 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	ATG23	Q06671	453 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	YEH1	Q07804	573 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	RSA1	Q08932	381 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	ARP6	Q12509	438 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
MOT2	YER068W	KSS1	P14681	368 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MOT2	YER068W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MOT2	YER068W	MRPL8	P22353	238 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MOT2	YER068W	YCR061W	P25639	631 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MOT2	YER068W	CHK1	P38147	527 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MOT2	YER068W	VID24	P38263	362 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MOT2	YER068W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MOT2	YER068W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MOT2	YER068W	JHD1	P40034	492 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MOT2	YER068W	PIG2	P40187	538 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MOT2	YER068W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MOT2	YER068W	INA22	P40576	216 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MOT2	YER068W	MTL1	P53214	551 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MOT2	YER068W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MOT2	YER068W	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MOT2	YER068W	REX3	Q12090	404 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MOT2	YER068W	YPR022C	Q12139	1133 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MOT2	YER068W	IES3	Q12345	250 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MOT2	YER068W	KOG1	P38873	1557 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MOT2	YER068W	USO1	P25386	1790 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MOT2	YER068W	SIR4	P11978	1358 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MOT2	YER068W	SOD2	P00447	233 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MOT2	YER068W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MOT2	YER068W	APE1	P14904	514 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MOT2	YER068W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.83	□□□□□ -1.64	not detected
MOT2	YER068W	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MOT2	YER068W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MOT2	YER068W	URK1	P27515	501 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MOT2	YER068W	CDC15	P27636	974 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MOT2	YER068W	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MOT2	YER068W	PPQ1	P32945	549 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MOT2	YER068W	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MOT2	YER068W	GEX2	P36173	615 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MOT2	YER068W	MAL33	P38157	468 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MOT2	YER068W	CST26	P38226	397 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MOT2	YER068W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MOT2	YER068W	BUD16	P39988	312 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MOT2	YER068W	SNL1	P40548	159 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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