RNA–Protein interactions for RNA: YDR093W

DNF2, Transcript of Aminophospholipid translocase (flippase), yeast

Gene DNF2, Length 4,839 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DNF2	YDR093W	TPP1	Q03796	238 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	TRM8	Q12009	286 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	ARG3	P05150	338 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	PIM1	P36775	1133 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	TSC10	P38342	320 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	YOR022C	Q12204	715 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	PDE2	P06776	526 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	RPC34	P32910	317 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	SDH3	P33421	198 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	PCL5	P38794	229 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	TMA108	P40462	946 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	SNL1	P40548	159 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	FET5	P43561	622 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	HOC1	P47124	396 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	COQ5	P49017	307 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.82	□□□□□ -1.64	not detected
DNF2	YDR093W	YPL107W	Q02873	248 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	TRS31	Q03337	283 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	NUP53	Q03790	475 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	GRX8	Q05926	109 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	EPT1	P22140	391 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	RCK2	P38623	610 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	MND2	P40577	368 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	LCB2	P40970	561 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	ROD1	Q02805	837 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	NSE1	Q07913	336 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	YPL199C	Q08954	240 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	NPR1	P22211	790 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	KIN82	P25341	720 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	TMT1	P32643	299 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	FLR1	P38124	548 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	NDT80	P38830	627 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	MEP2	P41948	499 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	MRX6	P48564	524 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	YMR206W	Q03695	313 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	FAR10	Q06001	478 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	SGO1	Q08490	590 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	FDH1	Q08911	376 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	MDY2	Q12285	212 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	PSY3	Q12318	242 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	TMA17	Q12513	150 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	ATP12	P22135	325 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	PBN1	P25580	416 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.81	□□□□□ -1.64	not detected
DNF2	YDR093W	TFB1	P32776	642 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	MAC1	P35192	417 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	COS111	P38308	924 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	ROG1	P53118	685 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	SSL2	Q00578	843 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	UBP2	Q01476	1272 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	YOL075C	Q08234	1294 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	DCI1	Q08558	271 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.81	□□□□□ -1.64	not detected
DNF2	YDR093W	TAE1	P38340	232 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	INM1	P38710	295 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	ATG7	P38862	630 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	YIR016W	P40572	265 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	RCF2	P53721	224 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	ARP4	P80428	489 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	STE7	P06784	515 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	SPE1	P08432	466 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	FAR1	P21268	830 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	RSC6	P25632	483 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	TRK2	P28584	889 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	AAD14	P42884	376 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	BNA6	P43619	295 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	SFH5	P47008	294 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	SWA2	Q06677	668 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	CYK3	Q07533	885 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	YOR012W	Q12351	137 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	CTF3	Q12748	733 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	SPR1	P32603	445 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	MDJ1	P35191	511 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	NAT2	P37293	288 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	YEL076C	P39971	216 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	MUK1	Q02866	612 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	YPR091C	Q06833	770 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	GYP1	Q08484	637 aa		4.81	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.7 ms