RNA–Protein interactions for RNA: YBL018C

POP8, Transcript of Subunit of both RNase MRP and nuclear RNase P, yeast

Gene POP8, Length 402 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
POP8	YBL018C	OCA4	P25366	362 aa		4.15	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	SNC1	P31109	117 aa		4.15	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	YER130C	P39959	443 aa		4.15	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	MET28	P40573	187 aa		4.15	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	IRC6	P43615	237 aa		4.15	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	MDM1	Q01846	1127 aa		4.15	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	YMR160W	Q03823	816 aa		4.15	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	COQ9	Q05779	260 aa		4.15	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	DIC1	Q06143	298 aa		4.15	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	RTP1	Q12751	981 aa		4.15	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	ARG3	P05150	338 aa		4.14	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	RAD24	P32641	659 aa		4.14	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	RMD8	P43620	662 aa		4.14	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	GUF1	P46943	645 aa		4.14	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	SNG1	P46950	547 aa		4.14	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	YGR126W	P53274	230 aa		4.14	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	DUG3	P53871	357 aa		4.14	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	YPL014W	Q02606	381 aa		4.14	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	FMP42	Q04991	504 aa		4.14	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	VPS38	Q05919	439 aa		4.14	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	YLR352W	Q06479	807 aa		4.14	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	SSK1	Q07084	712 aa		4.14	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	AVL9	Q12500	764 aa		4.14	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	GAL80	P04387	435 aa		4.13	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	BAR1	P12630	587 aa		4.13	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	PRD1	P25375	712 aa		4.13	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	RKM3	P38222	552 aa		4.13	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	YIR014W	P40570	242 aa		4.13	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	AZF1	P41696	914 aa		4.13	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	AIM22	P47051	409 aa		4.13	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	PET130	P47065	347 aa		4.13	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	BUD32	P53323	261 aa		4.13	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	RHO4	Q00246	291 aa		4.13	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	FIN1	Q03898	291 aa		4.13	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	YOR365C	Q08844	703 aa		4.13	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	ARP6	Q12509	438 aa		4.13	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	TYR1	P20049	452 aa		4.12	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	YHR210C	P38893	341 aa		4.12	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	DOT5	P40553	215 aa		4.12	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	ATG27	P46989	271 aa		4.12	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	MSS11	Q03825	758 aa		4.12	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	YDL057W	Q07379	328 aa		4.12	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	FMP45	Q07651	309 aa		4.12	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	TAH18	Q12181	623 aa		4.12	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	PEP5	P12868	1029 aa		4.11	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	PMS1	P14242	873 aa		4.11	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	CDC23	P16522	626 aa		4.11	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	GLN3	P18494	730 aa		4.11	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	ACH1	P32316	526 aa		4.11	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	MRE11	P32829	692 aa		4.11	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	MIC60	P36112	540 aa		4.11	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	MUM2	P38236	366 aa		4.11	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	MSR1	P38714	643 aa		4.11	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	MET18	P40469	1032 aa		4.11	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	AXL1	P40851	1208 aa		4.11	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	SHR3	Q02774	210 aa		4.11	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	CDC45	Q08032	650 aa		4.11	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	FOB1	O13329	566 aa		4.1	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	BZZ1	P38822	633 aa		4.1	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.1	□□□□□ -1.75	not detected
POP8	YBL018C	YJR154W	P47181	346 aa		4.1	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	MRPL19	P53875	158 aa		4.1	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	TOF2	Q02208	771 aa		4.1	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	THI20	Q08224	551 aa		4.1	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	CSR2	Q12734	1121 aa		4.1	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	CST26	P38226	397 aa		4.09	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	JJJ1	P53863	590 aa		4.09	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	SAM50	P53969	484 aa		4.09	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	TAF11	Q04226	346 aa		4.09	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	YMR087W	Q04299	284 aa		4.09	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	RBA50	Q04418	439 aa		4.09	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
POP8	YBL018C	MET17	P06106	444 aa		4.08	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	CKA1	P15790	372 aa		4.08	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	ROX1	P25042	368 aa		4.08	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	YME1	P32795	747 aa		4.08	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	SHP1	P34223	423 aa		4.08	□□□□□ -1.76

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