RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SH3BP2-222	ENST00000512014	RARB	P10826	455 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	14.89	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	ANTXR2	P58335	489 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	SNX17	Q15036	470 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	14.89	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	MORC4	Q8TE76	937 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	GDF15	Q99988	308 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	14.89	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	MYADML2	A6NDP7	307 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	CTAGE5	O15320	804 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	SYN1	P17600	705 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	14.88	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	14.88	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	14.88	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	NSMF	Q6X4W1	530 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	14.88	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	PHF24	Q9UPV7	400 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	14.88	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	14.87	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	KBTBD13	C9JR72	458 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	14.87	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	PTGS1	P23219	599 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	CHST3	Q7LGC8	479 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	14.86	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	14.86	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	RTP1	P59025	263 aa		14.86	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	NKX3-2	P78367	333 aa		14.86	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	NECTIN1	Q15223	517 aa		14.86	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	14.86	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		14.86	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		14.86	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	FERMT2	Q96AC1	680 aa		14.86	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	MTMR8	Q96EF0	704 aa		14.86	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	14.86	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	LTBP2	Q14767	1821 aa		14.85	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	ASB14	A6NK59	587 aa		14.85	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC27A2	O14975	620 aa		14.85	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	14.85	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	14.85	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	BMP8B	P34820	402 aa		14.85	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	14.85	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	14.85	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	GJA9	P57773	515 aa		14.85	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	14.85	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	TROAP	Q12815	778 aa		14.85	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRDN	Q13061	729 aa		14.85	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		14.85	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		14.85	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	RNF180	Q86T96	592 aa		14.85	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	NCOA7	Q8NI08	942 aa		14.85	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	TBC1D5	Q92609	795 aa		14.85	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	14.85	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		14.85	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	14.85	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	MYH6	P13533	1939 aa		14.85	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	14.84	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	14.84	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A1W2PQY0	241 aa		14.84	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	OPLAH	O14841	1288 aa		14.84	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	14.84	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	14.84	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	EDNRB	P24530	442 aa		14.84	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	GRM4	Q14833	912 aa		14.84	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	USH1G	Q495M9	461 aa		14.84	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRIM60	Q495X7	471 aa		14.84	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		14.84	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		14.84	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	14.84	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	14.84	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	COL20A1	Q9P218	1284 aa		14.84	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	PNMA2	Q9UL42	364 aa		14.84	□□□□□ -0.03
SH3BP2-222	ENST00000512014	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		14.83	□□□□□ -0.04
SH3BP2-222	ENST00000512014	KLRF2	D3W0D1	207 aa		14.83	□□□□□ -0.04
SH3BP2-222	ENST00000512014	CYTH3	O43739	400 aa		14.83	□□□□□ -0.04
SH3BP2-222	ENST00000512014	SMPD1	P17405	629 aa		14.83	□□□□□ -0.04
SH3BP2-222	ENST00000512014	CALML3	P27482	149 aa		14.83	□□□□□ -0.04
SH3BP2-222	ENST00000512014	ACLY	P53396	1101 aa		14.83	□□□□□ -0.04
SH3BP2-222	ENST00000512014	KCNA10	Q16322	511 aa		14.83	□□□□□ -0.04
SH3BP2-222	ENST00000512014	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		14.83	□□□□□ -0.04
SH3BP2-222	ENST00000512014	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	14.83	□□□□□ -0.04

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