RNA–Protein interactions for RNA: YPR069C

SPE3, Transcript of Spermidine synthase, yeastyeast

Gene SPE3, Length 882 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3YPR069C CAJ1P39101 391 aa6.8□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C PLB1P39105 664 aa6.8□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C MNN1P39106 762 aa6.8□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C MEP1P40260 492 aa6.8□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C YIL086CP40503 102 aa6.8□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C COS12P53053 380 aa6.8□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C ELP4Q02884 456 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C PEX25Q02969 394 aa6.8□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C RSF1Q05043 376 aa6.8□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C IRC13Q08630 104 aa6.8□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C LAT1P12695 482 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C MET8P15807 274 aa6.79□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C PAP1P29468 568 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C LYP1P32487 611 aa6.79□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C SFC1P33303 322 aa6.79□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C PBP2P38151 413 aaKnown RBP RIP-Chip data6.79□□□□□ -1.32not detected
SPE3YPR069C UTP18P40362 594 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C YFR020WP43600 232 aa6.79□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C MPS2P53159 387 aa6.79□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C MTQ2Q03920 221 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C SML1Q04964 104 aa6.79□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C SYT1Q06836 1226 aa6.79□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C NUS1Q12063 375 aa6.79□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C GCR1P07261 785 aa6.78□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C PRP16P15938 1071 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C URA4P20051 364 aa6.78□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C CLN2P20438 545 aa6.78□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C CLB1P24868 471 aa6.78□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C URA7P28274 579 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C MEI5P32489 222 aa6.78□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C YRO2P38079 344 aa6.78□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C YHI9P38765 294 aa6.78□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C GIC1P38785 314 aa6.78□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C YHR127WP38833 243 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C MPT5P39016 859 aaKnown RBP RIP-Chip data6.78□□□□□ -1.32not detected
SPE3YPR069C DHH1P39517 506 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C HAT2P39984 401 aa6.78□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C ELP2P42935 788 aa6.78□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C SAE2P46946 345 aa6.78□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C NMD5P46970 1048 aa6.78□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C APT1P49435 187 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C SGF73P53165 657 aa6.78□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C UTP6Q02354 440 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C CDC123Q05791 360 aa6.78□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C CDA2Q06703 312 aa6.78□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C MCD1Q12158 566 aa6.78□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C YPL066WQ12194 479 aa6.78□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C YLR111WQ12528 110 aa6.78□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C STE2D6VTK4 431 aa6.77□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C CMP2P14747 604 aa6.77□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C SEC62P21825 274 aa6.77□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C ARG1P22768 420 aa6.77□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C HRR25P29295 494 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C TPS2P31688 896 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C GCG1P32656 232 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C BEM3P32873 1128 aa6.77□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C SOL2P37262 315 aa6.77□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C FTH1P38310 465 aa6.77□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C SPF1P39986 1215 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C MAD1P40957 749 aa6.77□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C IKS1P47042 667 aa6.77□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C UBX6P47049 396 aa6.77□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C CCT8P47079 568 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C GCV1P48015 400 aa6.77□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C FHN1P53279 174 aa6.77□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C YGR250CP53316 781 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C PRO2P54885 456 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C AAT1Q01802 451 aa6.77□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C URH1Q04179 340 aa6.77□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C RSC2Q06488 889 aa6.77□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C MRH1Q12117 320 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C ICT1Q12385 394 aa6.77□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C PNO1Q99216 274 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C RPL43AP0CX25 92 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C RPL43BP0CX26 92 aa6.76□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C HOM3P10869 527 aa6.76□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C TYR1P20049 452 aa6.76□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C SFA1P32771 386 aa6.76□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C SEF1P34228 1148 aa6.76□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C CTP1P38152 299 aa6.76□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C AXL2P38928 823 aa6.76□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C ADE12P80210 433 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C ENT2Q05785 613 aa6.76□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C CDA1Q06702 301 aa6.76□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C ACM1Q08981 209 aa6.76□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C TMS1Q12116 473 aa6.76□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C UPC2Q12151 913 aa6.76□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C TEF1P02994 458 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C RAD1P06777 1100 aa6.75□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C PEP5P12868 1029 aa6.75□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C CBF1P17106 351 aa6.75□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C YCK2P23292 546 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C VAC17P25591 423 aa6.75□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C PRO1P32264 428 aa6.75□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C SRB5P32585 307 aa6.75□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C MFT1P33441 392 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C YHR210CP38893 341 aa6.75□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C RGA1P39083 1007 aa6.75□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C YGR015CP53208 328 aa6.75□□□□□ -1.33
SPE3YPR069C VTI1Q04338 217 aa6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15 ms