RNA–Protein interactions for RNA: YKR019C

IRS4, Transcript of EH domain-containing protein, yeast

Gene IRS4, Length 1,848 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IRS4	YKR019C	DSN1	P40568	576 aa		5.99	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	TWF1	P53250	332 aa		5.99	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	VPS60	Q03390	229 aa		5.99	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	WAR1	Q03631	944 aa		5.99	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	VPS74	Q06385	345 aa		5.99	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	GPN3	Q06543	272 aa		5.99	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	MTR10	Q99189	972 aa		5.99	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	YBR139W	P38109	508 aa		5.99	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	SHC1	P39000	512 aa		5.99	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	NDC80	P40460	691 aa		5.99	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	CAB2	P40506	365 aa		5.99	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	PET130	P47065	347 aa		5.99	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	YLR407W	Q06070	228 aa		5.99	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	SYT1	Q06836	1226 aa		5.99	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	VAM6	Q07468	1049 aa		5.99	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	SPE4	Q12455	300 aa		5.99	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	SFG1	Q12507	346 aa		5.99	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	YPT6	Q99260	215 aa		5.99	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	BEM1	P29366	551 aa		5.98	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	NTH1	P32356	751 aa		5.98	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	SIP1	P32578	815 aa		5.98	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	ALY1	P36117	915 aa		5.98	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	RCY1	P39531	840 aa		5.98	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	KAP114	P53067	1004 aa		5.98	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	SMA2	Q04658	369 aa		5.98	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	STE23	Q06010	1027 aa		5.98	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	RDR1	Q08904	546 aa		5.98	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		5.98	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	DIF1	O13577	133 aa		5.97	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	HIP1	P06775	603 aa		5.97	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	CHL1	P22516	861 aa	Predicted RBP	5.97	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	ERG8	P24521	451 aa		5.97	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	YKL151C	P36059	337 aa		5.97	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	CMC1	P36064	111 aa		5.97	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	CHK1	P38147	527 aa		5.97	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	SER3	P40054	469 aa		5.97	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	FMS1	P50264	508 aa		5.97	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	YKE2	P52553	114 aa		5.97	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	LIF1	P53150	421 aa		5.97	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	5.97	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	5.97	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	INN1	P53901	409 aa		5.97	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	DIA1	P54005	336 aa		5.97	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	ACS1	Q01574	713 aa		5.97	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	5.97	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	HRQ1	Q05549	1077 aa		5.97	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	BUD7	Q08754	746 aa		5.97	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	TIP41	Q12199	356 aa		5.97	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	GLO4	Q12320	285 aa		5.97	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	NDJ1	Q12366	352 aa		5.97	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	YLL067C	Q07888	1374 aa		5.97	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	YCL002C	P25565	263 aa		5.97	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	ATP7	P30902	174 aa		5.97	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	YME2	P32843	850 aa		5.97	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	YKR075C	P36155	307 aa		5.97	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	PFF1	P38244	976 aa		5.97	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	OPY1	P38271	328 aa		5.97	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	CCT6	P39079	546 aa		5.97	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	ZRG8	P40021	1076 aa		5.97	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	YNL181W	P53878	407 aa		5.97	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	SNA4	Q07549	140 aa		5.97	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	SVS1	Q12254	260 aa		5.97	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	YPR015C	Q12531	247 aa		5.97	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	YLR149C	Q99296	730 aa		5.97	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	VCX1	Q99385	411 aa		5.97	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	REV3	P14284	1504 aa		5.96	□□□□□ -1.45
IRS4	YKR019C	GAL4	P04386	881 aa		5.96	□□□□□ -1.46
IRS4	YKR019C	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
IRS4	YKR019C	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
IRS4	YKR019C	CMK2	P22517	447 aa		5.96	□□□□□ -1.46
IRS4	YKR019C	RAD14	P28519	371 aa		5.96	□□□□□ -1.46
IRS4	YKR019C	PMT1	P33775	817 aa		5.96	□□□□□ -1.46
IRS4	YKR019C	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	5.96	□□□□□ -1.46
IRS4	YKR019C	CDS1	P38221	457 aa		5.96	□□□□□ -1.46
IRS4	YKR019C	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.96	□□□□□ -1.46	not detected
IRS4	YKR019C	SLS1	P42900	643 aa		5.96	□□□□□ -1.46
IRS4	YKR019C	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46

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