RNA–Protein interactions for RNA: YGL196W

DSD1, Transcript of D-serine dehydratase (aka D-serine ammonia-lyase), yeast

Gene DSD1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSD1	YGL196W	STB2	P46679	850 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	BSP1	Q06604	576 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	TEN1	Q07921	160 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	CDC45	Q08032	650 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	YRF1-4	O13559	1382 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	SPO11	P23179	398 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	CPR2	P23285	205 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	OCT1	P35999	772 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	MIA40	P36046	403 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	MSR1	P38714	643 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	DBP8	P38719	431 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	YJL107C	P42947	387 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	STU2	P46675	888 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	KAP120	Q02932	1032 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	PFA5	Q03289	374 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	SGS1	P35187	1447 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	ARG81	P05085	880 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	APE1	P14904	514 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.63	not detected
DSD1	YGL196W	SNT1	P25357	1226 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	GAC1	P28006	793 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	HCS1	P34243	683 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	YKL100C	P34248	587 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	ARN1	P38731	627 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	ERV46	P39727	415 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	AIM32	Q04689	311 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	SOV1	Q04748	898 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	ROY1	Q04847	553 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	PDR8	Q06149	701 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	PIG1	Q06216	648 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	YOL159C	Q08300	171 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	ISN1	Q99312	450 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	YME1	P32795	747 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	MDL1	P33310	695 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	ZIM17	P42844	174 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	MSC1	Q03104	513 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	PDS5	Q04264	1277 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	DON1	Q05610	365 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	MCH4	Q08268	501 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	AFI1	Q99222	893 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	PUT2	P07275	575 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	GPA1	P08539	472 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	MNE1	P24720	663 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	YCR006C	P25350	157 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	PUP2	P32379	260 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	NIP100	P33420	868 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	PXL1	P36166	706 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	PIM1	P36775	1133 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	CAJ1	P39101	391 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	TOF2	Q02208	771 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	TAP42	Q04372	366 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	SWF1	Q04629	336 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	SUT2	Q12286	268 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	ADY2	P25613	283 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	RML2	P32611	393 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	TOA1	P32773	286 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	RXT2	P38255	430 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	TCB2	P48231	1178 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	UBP8	P50102	471 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	YGR016W	P53209	190 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	ASI1	P54074	624 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	OAZ1	Q02803	292 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	FMP30	Q02883	468 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	ATG26	Q06321	1198 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	ECM30	Q06673	1274 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	YLR111W	Q12528	110 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	SPT7	P35177	1332 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DSD1	YGL196W	TFB1	P32776	642 aa		4.8	□□□□□ -1.64

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