RNA–Protein interactions for RNA: YER068W

MOT2, Transcript of Ubiquitin-protein ligase subunit of the CCR4-NOT complex, yeast

Gene MOT2, Length 1,764 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MOT2	YER068W	ALY1	P36117	915 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	EHT1	P38295	451 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	STB5	P38699	743 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	RRF1	P38771	230 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	RPP1	P38786	293 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	LTP1	P40347	161 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	NMT1	P14743	455 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
MOT2	YER068W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	YME1	P32795	747 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	MRPL10	P36520	322 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	MRX3	P38172	270 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	SPT8	P38915	602 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	YJL193W	P39542	402 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	MTW1	P39731	289 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	GET2	P40056	285 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	SLZ1	P40167	298 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	RGI2	P40188	164 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	AGE2	P40529	298 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	AGX1	P43567	385 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	YJL055W	P47044	245 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	STB4	P50104	949 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	GLO1	P50107	326 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	SGF73	P53165	657 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	PEX25	Q02969	394 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	ABZ2	Q03266	374 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	PPM1	Q04081	328 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	SFH1	Q06168	426 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	THI22	Q06490	572 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
MOT2	YER068W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	TRM11	Q12463	433 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	TUS1	Q06412	1307 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	DAP2	P18962	818 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	GCS1	P35197	352 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	UBP11	P36026	717 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	MRPL17	P36528	281 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	SRO77	P38163	1010 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	SMF1	P38925	575 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	PCI8	P40512	444 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	YIL001W	P40560	513 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	SSU1	P41930	458 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	CHA4	P43634	648 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	STB2	P46679	850 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	IDS2	P46958	469 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	GCV2	P49095	1034 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
MOT2	YER068W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	RPM2	Q02773	1202 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	HER2	Q03557	464 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	DBF2	P22204	572 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	VPS34	P22543	875 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	HSP30	P25619	332 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	SMI1	P32566	505 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	REG2	P38232	338 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	COS111	P38308	924 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	SDH8	P38345	138 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	VMA22	P38784	181 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	LRO1	P40345	661 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	NPA3	P47122	385 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	COS12	P53053	380 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	TAM41	P53230	385 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	YGR066C	P53242	292 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	FIN1	Q03898	291 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	YFT2	Q06676	274 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	LOT6	Q07923	191 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	RIM20	Q12033	661 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	TGL5	Q12043	749 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	ULS1	Q08562	1619 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
MOT2	YER068W	KRE2	P27809	442 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	STB6	P36085	766 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	TOS1	P38288	455 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	SWC5	P38326	303 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MOT2	YER068W	LYS9	P38999	446 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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