RNA–Protein interactions for RNA: YDR369C

XRS2, Transcript of Protein required for DNA repair, yeast

Gene XRS2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
XRS2	YDR369C	GCN4	P03069	281 aa		3.59	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	ARG82	P07250	355 aa		3.59	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	MET2	P08465	486 aa		3.59	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	VPS34	P22543	875 aa		3.59	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	PTP2	P29461	750 aa		3.59	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	MKS1	P34072	584 aa		3.59	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	MTC2	P34246	357 aa		3.59	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	ELF1	P36053	145 aa		3.59	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.59	□□□□□ -1.83	not detected
XRS2	YDR369C	CST26	P38226	397 aa		3.59	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	SIF2	P38262	535 aa		3.59	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	SUL1	P38359	859 aa		3.59	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	YHR078W	P38799	552 aa		3.59	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	RAD55	P38953	406 aa		3.59	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	SAD1	P43589	448 aa		3.59	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	VPS70	P47161	811 aa		3.59	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	UBC12	P52491	188 aa		3.59	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	PMT5	P52867	743 aa		3.59	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	LSC2	P53312	427 aa		3.59	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	FOL1	P53848	824 aa		3.59	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	PFA5	Q03289	374 aa		3.59	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	TRM82	Q03774	444 aa		3.59	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	TDA9	Q04545	1251 aa		3.59	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	GPN3	Q06543	272 aa		3.59	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	THI3	Q07471	609 aa		3.59	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	SLD7	Q08457	257 aa		3.59	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	PHO5	P00635	467 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	COX4	P04037	155 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	TPK2	P06245	380 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	SPT3	P06844	337 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	PUT4	P15380	627 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	NPP1	P25353	742 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	DMC1	P25453	334 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	MGR1	P25573	417 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	CIN8	P27895	1000 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	GUT2	P32191	649 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	NDI1	P32340	513 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	KAP122	P32767	1081 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	MRP4	P32902	394 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	MCD4	P36051	919 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	YBR137W	P38276	179 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	PEX32	P38292	413 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	POP4	P38336	279 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	PTC7	P38797	343 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	YHR131C	P38835	850 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	LYS9	P38999	446 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	KRE29	P40026	464 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	DSE1	P40077	573 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	NDE1	P40215	560 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	NEO1	P40527	1151 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	LSB6	P42951	607 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	YFL034W	P43564	1073 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	MNN5	P46982	586 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	CCC1	P47818	322 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	GTO1	P48239	356 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	DOC1	P53068	250 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	RIM8	P53179	542 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	IMO32	P53219	342 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	LSB1	P53281	241 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	HHO1	P53551	258 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	YMD8	Q03697	442 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	BCH1	Q05029	724 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	CIA1	Q05583	330 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	PGC1	Q08959	321 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	THI21	Q08975	551 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	SKM1	Q12469	655 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	SCEI	P03882	235 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	WHI2	P12611	486 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	SNF4	P12904	322 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	RAD14	P28519	371 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	PTM1	P32857	523 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	MAP2	P38174	421 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	FUI1	P38196	639 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	MSG5	P38590	489 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	PAN5	P38787	379 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	RMD6	P39975	231 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	ALG8	P40351	577 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	PKP1	P40530	394 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	CIN1	P40987	1014 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	ALR2	P43553	858 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	YGR026W	P53217	278 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	COG5	P53951	403 aa		3.58	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	UBX4	P54730	416 aa		3.58	□□□□□ -1.84

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