RNA–Protein interactions for RNA: YCL054W

SPB1, Transcript of AdoMet-dependent methyltransferase, yeast

Gene SPB1, Length 2,526 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPB1	YCL054W	PPS1	P38148	807 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	REG2	P38232	338 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	LCB2	P40970	561 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	BTN2	P53286	410 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	VPS9	P54787	451 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	MFM1	Q02783	413 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	SWA2	Q06677	668 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	FMP45	Q07651	309 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	TCO89	Q08921	799 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	PCL8	Q08966	492 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	RIM20	Q12033	661 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	PUS9	Q12069	462 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	LAM4	P38800	1345 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	ALG7	P07286	448 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.74	□□□□□ -1.97	not detected
SPB1	YCL054W	ERV1	P27882	189 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	MRE11	P32829	692 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	PMT1	P33775	817 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	YKL100C	P34248	587 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	THI6	P41835	540 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	MAF1	P41910	395 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	RAD33	Q04231	177 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	SOV1	Q04748	898 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	ROY1	Q04847	553 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	VPS38	Q05919	439 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	BAG7	Q12128	409 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	NTO1	Q12311	748 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	LYS2	P07702	1392 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	GAL80	P04387	435 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	YCR051W	P25631	222 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	MDL1	P33310	695 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	NUP133	P36161	1157 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	MIT1	P40002	666 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	YIL166C	P40445	542 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	YGR066C	P53242	292 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	ATG4	P53867	494 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	TRS23	Q03784	219 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	ATG29	Q12092	213 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	RLM1	Q12224	676 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	MRP13	P12686	339 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	ELO2	P25358	347 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	YIH1	P25637	258 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	PUP2	P32379	260 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	EFM4	P40516	257 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	NAS2	P40555	220 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	ZIM17	P42844	174 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	PET130	P47065	347 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	CIK1	Q01649	594 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	RSM28	Q03430	361 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	ARG7	Q04728	441 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	HRD3	Q05787	833 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	MMR1	Q06324	491 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	YPT53	P36019	220 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	SAE2	P46946	345 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	MDE1	P47095	244 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	YML053C	Q04978	212 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	AIM39	Q08223	395 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	YPL216W	Q08964	1102 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	GPM3	Q12326	303 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	CEX1	Q12453	761 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	PET111	P08468	800 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	CLB3	P24870	427 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	CMC1	P36064	111 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	HEL1	P36113	551 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	APL3	P38065	1025 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	ARP1	P38696	384 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	PHM8	P40025	321 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
SPB1	YCL054W	TWF1	P53250	332 aa		2.72	□□□□□ -1.97

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