RNA–Protein interactions for RNA: Q0050

AI1, Reverse transcriptase required for splicing of the COX1 pre-mRNA, yeast

Gene AI1, Length 2,505 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI1	Q0050	PCT1	P13259	424 aa		0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	STE12	P13574	688 aa		0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	TUP1	P16649	713 aa		0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	CPR3	P25719	182 aa		0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	GSY2	P27472	705 aa		0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	RPB9	P27999	122 aa		0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	CDC11	P32458	415 aa		0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	SFC1	P33303	322 aa		0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	TKL2	P33315	681 aa		0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	HEL1	P36113	551 aa		0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	TDA3	P38758	523 aa		0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	SMF1	P38925	575 aa		0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	AZF1	P41696	914 aa		0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YIP4	P53093	235 aa		0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	RSC1	P53236	928 aa		0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	SPC98	P53540	846 aa		0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	MUB1	Q03162	620 aa		0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	CCE1	Q03702	353 aa		0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YPR196W	Q06595	470 aa		0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	PLB3	Q08108	686 aa		0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	AKR2	Q12013	749 aa		0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	TPK1	P06244	397 aa		0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	PRB1	P09232	635 aa		0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YLR464W	P0CX17	216 aa		0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	PLC1	P32383	869 aa		0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	COT1	P32798	439 aa		0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	REC104	P33323	182 aa		0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	GRX7	P38068	203 aa		0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YBR225W	P38321	900 aa		0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	BIT2	P38346	545 aa		0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	NDT80	P38830	627 aa		0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	REV7	P38927	245 aa		0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YEL076C	P39971	216 aa		0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	EAF5	P39995	279 aa		0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	VTC2	P43585	828 aa		0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	ZIP2	P53061	704 aa		0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	TAD1	P53065	400 aa		0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YGR151C	P53287	111 aa		0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YPR003C	P53394	754 aa		0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	ZRG17	P53735	605 aa		0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	VPS30	Q02948	557 aa		0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YMR160W	Q03823	816 aa		0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YDR131C	Q03899	556 aa		0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	CUR1	Q06469	252 aa		0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.49	□□□□□ -2.33	not detected
AI1	Q0050	YLR012C	Q07927	99 aa		0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YRM1	Q12340	786 aa		0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	Q0297	Q9ZZV8	51 aa		0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	AQY1	P0CD91	305 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YMR085W	P0CF18	432 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.48	□□□□□ -2.33	RIP-Chip
AI1	Q0050	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	PPH21	P23594	369 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	RIT1	P23796	513 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	SPS22	P25380	463 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	CWH43	P25618	953 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	PMT1	P33775	817 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	MNR2	P35724	969 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	NUP133	P36161	1157 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YRO2	P38079	344 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YPT10	P38146	199 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	MMS4	P38257	691 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	COS111	P38308	924 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	FHL1	P39521	936 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YIL169C	P40442	995 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YIL067C	P40514	678 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	FIS1	P40515	155 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	MNT3	P40549	630 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YFR018C	P43599	363 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	LCL3	P53153	274 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	CUL3	P53202	744 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YTP1	P53584	459 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	TEP1	P53916	434 aa		0.48	□□□□□ -2.33

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