RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470271.5

CTPS1-206, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-206ENST00000470271 PGK2P07205 417 aa23.31■■□□□ 1.32
CTPS1-206ENST00000470271 CAPN2P17655 700 aa23.31■■□□□ 1.32
CTPS1-206ENST00000470271 CYP2C19P33261 490 aa23.31■■□□□ 1.32
CTPS1-206ENST00000470271 NECTIN1Q15223 517 aa23.31■■□□□ 1.32
CTPS1-206ENST00000470271 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP23.31■■□□□ 1.32
CTPS1-206ENST00000470271 MAML3Q96JK9 1138 aa23.31■■□□□ 1.32
CTPS1-206ENST00000470271 AGBL1Q96MI9 1066 aa23.31■■□□□ 1.32
CTPS1-206ENST00000470271 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
CTPS1-206ENST00000470271 HOMER2Q9NSB8 354 aa23.31■■□□□ 1.32
CTPS1-206ENST00000470271 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa23.31■■□□□ 1.32
CTPS1-206ENST00000470271 SLC27A2O14975 620 aa23.3■■□□□ 1.32
CTPS1-206ENST00000470271 GOLGA8HP0CJ92 632 aa23.3■■□□□ 1.32
CTPS1-206ENST00000470271 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
CTPS1-206ENST00000470271 SART3Q15020 963 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
CTPS1-206ENST00000470271 TKFCQ3LXA3 575 aa23.3■■□□□ 1.32
CTPS1-206ENST00000470271 CREB3L3Q68CJ9 461 aa23.3■■□□□ 1.32
CTPS1-206ENST00000470271 DDX11Q96FC9 970 aa23.3■■□□□ 1.32
CTPS1-206ENST00000470271 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa23.3■■□□□ 1.32
CTPS1-206ENST00000470271 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
CTPS1-206ENST00000470271 ERICH2A1L162 156 aa23.29■■□□□ 1.32
CTPS1-206ENST00000470271 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF792Q3KQV3 632 aa23.29■■□□□ 1.32
CTPS1-206ENST00000470271 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
CTPS1-206ENST00000470271 ANKRD35Q8N283 1001 aa23.29■■□□□ 1.32
CTPS1-206ENST00000470271 ACAD9Q9H845 621 aa23.29■■□□□ 1.32
CTPS1-206ENST00000470271 RNF146Q9NTX7 359 aa23.29■■□□□ 1.32
CTPS1-206ENST00000470271 CCPG1Q9ULG6 757 aa23.29■■□□□ 1.32
CTPS1-206ENST00000470271 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa23.28■■□□□ 1.32
CTPS1-206ENST00000470271 ICAM1P05362 532 aa23.28■■□□□ 1.32
CTPS1-206ENST00000470271 ALAS1P13196 640 aa23.28■■□□□ 1.32
CTPS1-206ENST00000470271 ASPRV1Q53RT3 343 aa23.28■■□□□ 1.32
CTPS1-206ENST00000470271 CHST3Q7LGC8 479 aa23.28■■□□□ 1.32
CTPS1-206ENST00000470271 TRERF1Q96PN7 1200 aa23.28■■□□□ 1.32
CTPS1-206ENST00000470271 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa23.27■■□□□ 1.32
CTPS1-206ENST00000470271 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
CTPS1-206ENST00000470271 WTAPQ15007 396 aa23.27■■□□□ 1.32
CTPS1-206ENST00000470271 RNF20Q5VTR2 975 aa23.27■■□□□ 1.32
CTPS1-206ENST00000470271 CYBAP13498 195 aa23.26■■□□□ 1.31
CTPS1-206ENST00000470271 ANTXR2P58335 489 aa23.26■■□□□ 1.31
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM67Q5HYA8 995 aa23.26■■□□□ 1.31
CTPS1-206ENST00000470271 UBA5Q9GZZ9 404 aa23.26■■□□□ 1.31
CTPS1-206ENST00000470271 CPVLQ9H3G5 476 aa23.26■■□□□ 1.31
CTPS1-206ENST00000470271 PNMA2Q9UL42 364 aa23.26■■□□□ 1.31
CTPS1-206ENST00000470271 SMCHD1A6NHR9 2005 aa23.25■■□□□ 1.31
CTPS1-206ENST00000470271 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
CTPS1-206ENST00000470271 CNGA1P29973 690 aa23.25■■□□□ 1.31
CTPS1-206ENST00000470271 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa23.25■■□□□ 1.31
CTPS1-206ENST00000470271 TRPV1Q8NER1 839 aa23.25■■□□□ 1.31
CTPS1-206ENST00000470271 TINF2Q9BSI4 451 aa23.25■■□□□ 1.31
CTPS1-206ENST00000470271 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
CTPS1-206ENST00000470271 OGDHLQ9ULD0 1010 aa23.25■■□□□ 1.31
CTPS1-206ENST00000470271 MCM5P33992 734 aa23.24■■□□□ 1.31
CTPS1-206ENST00000470271 MUM1L1Q5H9M0 696 aa23.24■■□□□ 1.31
CTPS1-206ENST00000470271 LHX8Q68G74 356 aa23.24■■□□□ 1.31
CTPS1-206ENST00000470271 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
CTPS1-206ENST00000470271 ANKLE1Q8NAG6 615 aa23.24■■□□□ 1.31
CTPS1-206ENST00000470271 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa23.24■■□□□ 1.31
CTPS1-206ENST00000470271 SENP2Q9HC62 589 aa23.24■■□□□ 1.31
CTPS1-206ENST00000470271 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
CTPS1-206ENST00000470271 PRC1O43663 620 aa23.23■■□□□ 1.31
CTPS1-206ENST00000470271 MSCO60682 206 aa23.23■■□□□ 1.31
CTPS1-206ENST00000470271 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
CTPS1-206ENST00000470271 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa23.23■■□□□ 1.31
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
CTPS1-206ENST00000470271 MTA3Q9BTC8 594 aa23.23■■□□□ 1.31
CTPS1-206ENST00000470271 NRBP1Q9UHY1 535 aa23.23■■□□□ 1.31
CTPS1-206ENST00000470271 PFASO15067 1338 aa23.23■■□□□ 1.31
CTPS1-206ENST00000470271 WDR19Q8NEZ3 1342 aa23.23■■□□□ 1.31
CTPS1-206ENST00000470271 POTEB2H3BUK9 544 aa23.22■■□□□ 1.31
CTPS1-206ENST00000470271 ADGRF4Q8IZF3 695 aa23.22■■□□□ 1.31
CTPS1-206ENST00000470271 STAG2Q8N3U4 1231 aa23.22■■□□□ 1.31
CTPS1-206ENST00000470271 SEPT4O43236 478 aa23.21■■□□□ 1.31
CTPS1-206ENST00000470271 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
CTPS1-206ENST00000470271 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
CTPS1-206ENST00000470271 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa23.21■■□□□ 1.31
CTPS1-206ENST00000470271 CATIPQ7Z7H3 387 aa23.21■■□□□ 1.31
CTPS1-206ENST00000470271 FAM133AQ8N9E0 248 aa23.21■■□□□ 1.31
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM87BQ96K49 555 aa23.21■■□□□ 1.31
CTPS1-206ENST00000470271 LY9Q9HBG7 655 aa23.21■■□□□ 1.31
CTPS1-206ENST00000470271 MAD2L2Q9UI95 211 aa23.21■■□□□ 1.31
CTPS1-206ENST00000470271 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa23.21■■□□□ 1.31
CTPS1-206ENST00000470271 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
CTPS1-206ENST00000470271 KLRF2D3W0D1 207 aa23.2■■□□□ 1.3
CTPS1-206ENST00000470271 CNTN2Q02246 1040 aa23.2■■□□□ 1.3
CTPS1-206ENST00000470271 TROAPQ12815 778 aa23.2■■□□□ 1.3
CTPS1-206ENST00000470271 GRM4Q14833 912 aa23.2■■□□□ 1.3
CTPS1-206ENST00000470271 TSGA10IPQ3SY00 556 aa23.2■■□□□ 1.3
CTPS1-206ENST00000470271 NSMFQ6X4W1 530 aa23.2■■□□□ 1.3
CTPS1-206ENST00000470271 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
CTPS1-206ENST00000470271 FGD4Q96M96 766 aa23.2■■□□□ 1.3
CTPS1-206ENST00000470271 VAT1LQ9HCJ6 419 aa23.2■■□□□ 1.3
CTPS1-206ENST00000470271 CYP39A1Q9NYL5 469 aa23.2■■□□□ 1.3
CTPS1-206ENST00000470271 CNPY2Q9Y2B0 182 aa23.2■■□□□ 1.3
CTPS1-206ENST00000470271 REC8O95072 547 aa23.19■■□□□ 1.3
CTPS1-206ENST00000470271 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
CTPS1-206ENST00000470271 NECAB2Q7Z6G3 386 aa23.19■■□□□ 1.3
CTPS1-206ENST00000470271 RASEFQ8IZ41 740 aa23.19■■□□□ 1.3
CTPS1-206ENST00000470271 TMTC2Q8N394 836 aa23.19■■□□□ 1.3
CTPS1-206ENST00000470271 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
CTPS1-206ENST00000470271 NEK1Q96PY6 1258 aa23.19■■□□□ 1.3
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