RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 SHISA4Q96DD7 197 aa29.28■■■□□ 2.28
HTATSF1-202ENST00000425695 DDX11Q96FC9 970 aa29.28■■■□□ 2.28
HTATSF1-202ENST00000425695 UBA5Q9GZZ9 404 aa29.28■■■□□ 2.28
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF236Q9UL36 1845 aa29.28■■■□□ 2.28
HTATSF1-202ENST00000425695 TFRCP02786 760 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
HTATSF1-202ENST00000425695 ALAS1P13196 640 aa29.27■■■□□ 2.28
HTATSF1-202ENST00000425695 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
HTATSF1-202ENST00000425695 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
HTATSF1-202ENST00000425695 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
HTATSF1-202ENST00000425695 CHST13Q8NET6 341 aa29.27■■■□□ 2.28
HTATSF1-202ENST00000425695 SENP2Q9HC62 589 aa29.27■■■□□ 2.28
HTATSF1-202ENST00000425695 ERICH2A1L162 156 aa29.26■■■□□ 2.27
HTATSF1-202ENST00000425695 ANTXR2P58335 489 aa29.26■■■□□ 2.27
HTATSF1-202ENST00000425695 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
HTATSF1-202ENST00000425695 ANKRD35Q8N283 1001 aa29.26■■■□□ 2.27
HTATSF1-202ENST00000425695 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
HTATSF1-202ENST00000425695 RNF146Q9NTX7 359 aa29.26■■■□□ 2.27
HTATSF1-202ENST00000425695 CCPG1Q9ULG6 757 aa29.26■■■□□ 2.27
HTATSF1-202ENST00000425695 BRCA2P51587 3418 aa29.25■■■□□ 2.27
HTATSF1-202ENST00000425695 WTAPQ15007 396 aa29.25■■■□□ 2.27
HTATSF1-202ENST00000425695 SART3Q15020 963 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM67Q5HYA8 995 aa29.25■■■□□ 2.27
HTATSF1-202ENST00000425695 MAML3Q96JK9 1138 aa29.25■■■□□ 2.27
HTATSF1-202ENST00000425695 TRERF1Q96PN7 1200 aa29.25■■■□□ 2.27
HTATSF1-202ENST00000425695 FBXO40Q9UH90 709 aa29.25■■■□□ 2.27
HTATSF1-202ENST00000425695 SMCHD1A6NHR9 2005 aa29.25■■■□□ 2.27
HTATSF1-202ENST00000425695 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF792Q3KQV3 632 aa29.24■■■□□ 2.27
HTATSF1-202ENST00000425695 OLFML2BQ68BL8 750 aa29.24■■■□□ 2.27
HTATSF1-202ENST00000425695 ACAD9Q9H845 621 aa29.24■■■□□ 2.27
HTATSF1-202ENST00000425695 CNGA1P29973 690 aa29.23■■■□□ 2.27
HTATSF1-202ENST00000425695 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
HTATSF1-202ENST00000425695 RNF20Q5VTR2 975 aa29.23■■■□□ 2.27
HTATSF1-202ENST00000425695 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
HTATSF1-202ENST00000425695 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa29.23■■■□□ 2.27
HTATSF1-202ENST00000425695 PRC1O43663 620 aa29.22■■■□□ 2.27
HTATSF1-202ENST00000425695 ICAM1P05362 532 aa29.22■■■□□ 2.27
HTATSF1-202ENST00000425695 TKFCQ3LXA3 575 aa29.22■■■□□ 2.27
HTATSF1-202ENST00000425695 ASPRV1Q53RT3 343 aa29.22■■■□□ 2.27
HTATSF1-202ENST00000425695 MUM1L1Q5H9M0 696 aa29.22■■■□□ 2.27
HTATSF1-202ENST00000425695 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa29.22■■■□□ 2.27
HTATSF1-202ENST00000425695 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa29.22■■■□□ 2.27
HTATSF1-202ENST00000425695 VAT1LQ9HCJ6 419 aa29.22■■■□□ 2.27
HTATSF1-202ENST00000425695 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
HTATSF1-202ENST00000425695 IGHA2P01877 340 aa29.21■■■□□ 2.27
HTATSF1-202ENST00000425695 MCM5P33992 734 aa29.21■■■□□ 2.27
HTATSF1-202ENST00000425695 STAG2Q8N3U4 1231 aa29.21■■■□□ 2.27
HTATSF1-202ENST00000425695 TRPV1Q8NER1 839 aa29.21■■■□□ 2.27
HTATSF1-202ENST00000425695 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
HTATSF1-202ENST00000425695 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa29.2■■■□□ 2.26
HTATSF1-202ENST00000425695 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
HTATSF1-202ENST00000425695 RASEFQ8IZ41 740 aa29.2■■■□□ 2.26
HTATSF1-202ENST00000425695 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa29.2■■■□□ 2.26
HTATSF1-202ENST00000425695 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP29.19■■■□□ 2.26
HTATSF1-202ENST00000425695 ADGRF4Q8IZF3 695 aa29.19■■■□□ 2.26
HTATSF1-202ENST00000425695 TINF2Q9BSI4 451 aa29.19■■■□□ 2.26
HTATSF1-202ENST00000425695 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
HTATSF1-202ENST00000425695 CYBAP13498 195 aa29.18■■■□□ 2.26
HTATSF1-202ENST00000425695 NSMFQ6X4W1 530 aa29.18■■■□□ 2.26
HTATSF1-202ENST00000425695 LRRC2Q9BYS8 371 aa29.18■■■□□ 2.26
HTATSF1-202ENST00000425695 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
HTATSF1-202ENST00000425695 CNTN2Q02246 1040 aa29.17■■■□□ 2.26
HTATSF1-202ENST00000425695 CATIPQ7Z7H3 387 aa29.17■■■□□ 2.26
HTATSF1-202ENST00000425695 LY9Q9HBG7 655 aa29.17■■■□□ 2.26
HTATSF1-202ENST00000425695 MAD2L2Q9UI95 211 aa29.17■■■□□ 2.26
HTATSF1-202ENST00000425695 KLRF2D3W0D1 207 aa29.16■■■□□ 2.26
HTATSF1-202ENST00000425695 POTEB2H3BUK9 544 aa29.16■■■□□ 2.26
HTATSF1-202ENST00000425695 GRM4Q14833 912 aa29.16■■■□□ 2.26
HTATSF1-202ENST00000425695 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
HTATSF1-202ENST00000425695 USH1GQ495M9 461 aa29.16■■■□□ 2.26
HTATSF1-202ENST00000425695 LHX8Q68G74 356 aa29.16■■■□□ 2.26
HTATSF1-202ENST00000425695 NUP133Q8WUM0 1156 aa29.16■■■□□ 2.26
HTATSF1-202ENST00000425695 NEK1Q96PY6 1258 aa29.16■■■□□ 2.26
HTATSF1-202ENST00000425695 JMJD4Q9H9V9 463 aa29.16■■■□□ 2.26
HTATSF1-202ENST00000425695 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
HTATSF1-202ENST00000425695 ADCK5Q3MIX3 580 aa29.15■■■□□ 2.26
HTATSF1-202ENST00000425695 ANO1Q5XXA6 986 aa29.15■■■□□ 2.26
HTATSF1-202ENST00000425695 NFXL1Q6ZNB6 911 aa29.15■■■□□ 2.26
HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM87BQ96K49 555 aa29.15■■■□□ 2.26
HTATSF1-202ENST00000425695 MYL10Q9BUA6 226 aa29.15■■■□□ 2.26
HTATSF1-202ENST00000425695 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa29.15■■■□□ 2.26
HTATSF1-202ENST00000425695 NFIBO00712 420 aa29.14■■■□□ 2.26
HTATSF1-202ENST00000425695 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
HTATSF1-202ENST00000425695 REC8O95072 547 aa29.14■■■□□ 2.26
HTATSF1-202ENST00000425695 TROAPQ12815 778 aa29.14■■■□□ 2.26
HTATSF1-202ENST00000425695 FGD4Q96M96 766 aa29.14■■■□□ 2.26
HTATSF1-202ENST00000425695 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
HTATSF1-202ENST00000425695 OGDHLQ9ULD0 1010 aa29.14■■■□□ 2.26
HTATSF1-202ENST00000425695 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 QRICH1Q2TAL8 776 aa29.13■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 TSGA10IPQ3SY00 556 aa29.13■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa29.13■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF654Q8IZM8 581 aa29.13■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM133AQ8N9E0 248 aa29.13■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 MTA3Q9BTC8 594 aa29.13■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 CYP39A1Q9NYL5 469 aa29.13■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 PNMA2Q9UL42 364 aa29.13■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 PFASO15067 1338 aa29.13■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 SOWAHBA6NEL2 793 aa29.12■■■□□ 2.25
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