RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001520.12

Afg3l1-201, Transcript of AFG3-like protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Afg3l1, Length 4,227 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Haus1Q8BHX1 278 aa13.41□□□□□ -0.26
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Apobec3Q99J72 440 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Grin2dQ03391 1323 aa13.41□□□□□ -0.26
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Zc3h13E9Q784 1729 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Flot1O08917 428 aa13.4□□□□□ -0.26
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Stat3P42227 770 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Kctd19Q562E2 927 aa13.4□□□□□ -0.26
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ccpg1Q640L3 753 aa13.4□□□□□ -0.26
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ccdc189Q6NZQ0 333 aa13.4□□□□□ -0.26
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ube2oQ6ZPJ3 1288 aa13.4□□□□□ -0.26
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 SowahdQ8BY98 327 aa13.4□□□□□ -0.26
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ifih1Q8R5F7 1025 aa13.4□□□□□ -0.26
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Fbxo3Q9DC63 480 aa13.4□□□□□ -0.26
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Atp1a4Q9WV27 1032 aa13.4□□□□□ -0.26
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Col16a1Q8BLX7 1580 aa13.4□□□□□ -0.26
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Zfp408H7BX78 710 aa13.4□□□□□ -0.26
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Bnip3O55003 187 aa13.4□□□□□ -0.26
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 LtbrP50284 415 aa13.4□□□□□ -0.26
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Fkbp3Q62446 224 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Armcx3Q8BHS6 379 aa13.4□□□□□ -0.26
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Lrrc45Q8CIM1 670 aa13.4□□□□□ -0.26
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Afg3l2Q8JZQ2 802 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Vmn1r199Q8R280 367 aa13.4□□□□□ -0.26
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Bpifb4A2BGH0 617 aa13.4□□□□□ -0.26
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Pfkfb3A7UAK5 555 aa13.4□□□□□ -0.26
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm42641I6L9G2 585 aa13.4□□□□□ -0.26
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ap1b1O35643 943 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Sox5P35710 763 aa13.4□□□□□ -0.26
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Traf5P70191 558 aa13.4□□□□□ -0.26
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Psd3Q2PFD7 1037 aa13.4□□□□□ -0.26
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Prl2c1Q5SVL9 228 aa13.4□□□□□ -0.26
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gas8Q60779 478 aa13.4□□□□□ -0.26
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 AtripQ8BMG1 785 aa13.4□□□□□ -0.26
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ttc8Q8VD72 515 aa13.4□□□□□ -0.26
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Lzts2Q91YU6 671 aa13.4□□□□□ -0.26
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Sgpp1Q9JI99 430 aa13.4□□□□□ -0.26
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Fyb2A2A995 729 aa13.4□□□□□ -0.26
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ugt1a8D3Z748 530 aa13.4□□□□□ -0.26
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ugt1a10E9PXN7 530 aa13.4□□□□□ -0.26
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Tmem132dQ76HP3 1097 aa13.4□□□□□ -0.26
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Tor4aQ8BH02 426 aa13.4□□□□□ -0.26
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Kiaa1524Q8BWY9 907 aa13.4□□□□□ -0.26
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Yipf1Q91VU1 306 aa13.4□□□□□ -0.26
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Fkbp1aP26883 108 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 GnptabQ69ZN6 1235 aa13.39□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Igsf3Q6ZQA6 1194 aa13.39□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Efhd1Q9D4J1 240 aa13.39□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Nup153E9Q3G8 1462 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Kiaa1468Q148V7 1216 aa13.39□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Nlrx1Q3TL44 975 aa13.39□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Myo1hQ9D6A1 958 aa13.39□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Cd2apQ9JLQ0 637 aa13.39□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Znf394Q9Z1D9 521 aa13.39□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Cpsf2O35218 782 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ighmbp2P40694 993 aa13.39□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Stim2P83093 746 aa13.39□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Rpusd2Q149F1 553 aa13.39□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Myo19Q5SV80 963 aa13.39□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 P4ha1Q60715 534 aa13.39□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 WaplQ65Z40 1200 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ccdc148Q6P5U8 527 aa13.39□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 BaatQ91X34 420 aa13.39□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ubxn1Q922Y1 297 aa13.39□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Itsn1Q9Z0R4 1714 aa13.39□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Trip13Q3UA06 432 aa13.38□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gucy2cQ3UWA6 1072 aa13.38□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Krt14Q61781 484 aa13.38□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Clec16aQ80U30 1036 aa13.38□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 NapgQ9CWZ7 312 aa13.38□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Vstm4T1NXB5 319 aa13.38□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Spef2Q8C9J3 1734 aa13.38□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Dnaaf5B9EJR8 853 aa13.38□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Zfp213E9QAW0 468 aa13.38□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 DSCC1Q14AI0 399 aa13.38□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 RalylQ8BTF8 293 aa13.38□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Tdrd3Q91W18 743 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Vnn1Q9Z0K8 512 aa13.38□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Frmd7A2AD83 703 aa13.38□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ccng2O08918 344 aa13.38□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 P4hbP09103 509 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Acot10Q32MW3 439 aa13.38□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ap5z1Q3U829 807 aa13.38□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Naa35Q6PHQ8 725 aa13.38□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 GypcQ78HU7 95 aa13.38□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Klhl7Q8BUL5 586 aa13.38□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Coa7Q921H9 231 aa13.38□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Mad2l2Q9D752 211 aa13.38□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Tnrc6bQ8BKI2 1810 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Idh1O88844 414 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Kcna1P16388 495 aa13.37□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Plekhf1Q3TB82 279 aa13.37□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Znf532Q6NXK2 1036 aa13.37□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Trak2Q6P9N8 913 aa13.37□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ddx39aQ8VDW0 427 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Rhbdl3P58873 404 aa13.37□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Med10Q9CXU0 135 aa13.37□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Dctpp1Q9QY93 170 aa13.37□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Vps33bP59016 617 aa13.37□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Mars2Q499X9 586 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Nsrp1Q5NCR9 542 aa13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 16.2 ms