Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC45,55■■■■■ 4,88
Rpusd2Q149F1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42,08■■■■■ 4,33
Rpusd2Q149F1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,48■■■■■ 4,23
Rpusd2Q149F1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39,83■■■■□ 3,97
Rpusd2Q149F1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC39,48■■■■□ 3,91
Rpusd2Q149F1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,48■■■■□ 3,91
Rpusd2Q149F1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39,03■■■■□ 3,84
Rpusd2Q149F1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,75■■■■□ 3,79
Rpusd2Q149F1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,59■■■■□ 3,77
Rpusd2Q149F1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,45■■■■□ 3,75
Rpusd2Q149F1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,21■■■■□ 3,71
Rpusd2Q149F1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38,09■■■■□ 3,69
Rpusd2Q149F1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38,01■■■■□ 3,68
Rpusd2Q149F1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,83■■■■□ 3,65
Rpusd2Q149F1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,29■■■■□ 3,56
Rpusd2Q149F1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,21■■■■□ 3,55
Rpusd2Q149F1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37,05■■■■□ 3,52
Rpusd2Q149F1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,89■■■■□ 3,5
Rpusd2Q149F1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36,78■■■■□ 3,48
Rpusd2Q149F1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,77■■■■□ 3,48
Rpusd2Q149F1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36,76■■■■□ 3,48
Rpusd2Q149F1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36,55■■■■□ 3,44
Rpusd2Q149F1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,52■■■■□ 3,44
Rpusd2Q149F1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,48■■■■□ 3,43
Rpusd2Q149F1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,45■■■■□ 3,43
Rpusd2Q149F1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,43■■■■□ 3,42
Rpusd2Q149F1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,4■■■■□ 3,42
Rpusd2Q149F1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36,37■■■■□ 3,41
Rpusd2Q149F1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36,3■■■■□ 3,4
Rpusd2Q149F1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36,27■■■■□ 3,4
Rpusd2Q149F1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,16■■■■□ 3,38
Rpusd2Q149F1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,1■■■■□ 3,37
Rpusd2Q149F1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,06■■■■□ 3,36
Rpusd2Q149F1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,02■■■■□ 3,36
Rpusd2Q149F1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35,97■■■■□ 3,35
Rpusd2Q149F1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35,85■■■■□ 3,33
Rpusd2Q149F1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,69■■■■□ 3,3
Rpusd2Q149F1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35,6■■■■□ 3,29
Rpusd2Q149F1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,35■■■■□ 3,25
Rpusd2Q149F1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,33■■■■□ 3,25
Rpusd2Q149F1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,3■■■■□ 3,24
Rpusd2Q149F1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35,21■■■■□ 3,23
Rpusd2Q149F1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,19■■■■□ 3,22
Rpusd2Q149F1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35,08■■■■□ 3,21
Rpusd2Q149F1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,01■■■■□ 3,2
Rpusd2Q149F1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3,19
Rpusd2Q149F1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34,96■■■■□ 3,19
Rpusd2Q149F1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34,91■■■■□ 3,18
Rpusd2Q149F1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34,9■■■■□ 3,18
Rpusd2Q149F1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,84■■■■□ 3,17
Rpusd2Q149F1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34,82■■■■□ 3,16
Rpusd2Q149F1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,75■■■■□ 3,15
Rpusd2Q149F1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34,72■■■■□ 3,15
Rpusd2Q149F1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34,64■■■■□ 3,14
Rpusd2Q149F1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,64■■■■□ 3,14
Rpusd2Q149F1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34,49■■■■□ 3,11
Rpusd2Q149F1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,41■■■■□ 3,1
Rpusd2Q149F1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,4■■■■□ 3,1
Rpusd2Q149F1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34,36■■■■□ 3,09
Rpusd2Q149F1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,35■■■■□ 3,09
Rpusd2Q149F1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34,34■■■■□ 3,09
Rpusd2Q149F1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,28■■■■□ 3,08
Rpusd2Q149F1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34,26■■■■□ 3,07
Rpusd2Q149F1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34,25■■■■□ 3,07
Rpusd2Q149F1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Rpusd2Q149F1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34,13■■■■□ 3,05
Rpusd2Q149F1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Rpusd2Q149F1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
Rpusd2Q149F1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34,01■■■■□ 3,04
Rpusd2Q149F1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
Rpusd2Q149F1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33,98■■■■□ 3,03
Rpusd2Q149F1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33,98■■■■□ 3,03
Rpusd2Q149F1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,96■■■■□ 3,03
Rpusd2Q149F1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,03
Rpusd2Q149F1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33,95■■■■□ 3,03
Rpusd2Q149F1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
Rpusd2Q149F1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,89■■■■□ 3,02
Rpusd2Q149F1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Rpusd2Q149F1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33,86■■■■□ 3,01
Rpusd2Q149F1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
Rpusd2Q149F1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33,79■■■■□ 3
Rpusd2Q149F1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC33,79■■■■□ 3
Rpusd2Q149F1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,76■■■□□ 2,99
Rpusd2Q149F1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,7■■■□□ 2,98
Rpusd2Q149F1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33,66■■■□□ 2,98
Rpusd2Q149F1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33,65■■■□□ 2,98
Rpusd2Q149F1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33,63■■■□□ 2,97
Rpusd2Q149F1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,63■■■□□ 2,97
Rpusd2Q149F1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,6■■■□□ 2,97
Rpusd2Q149F1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33,59■■■□□ 2,97
Rpusd2Q149F1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,56■■■□□ 2,96
Rpusd2Q149F1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,56■■■□□ 2,96
Rpusd2Q149F1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,53■■■□□ 2,96
Rpusd2Q149F1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,48■■■□□ 2,95
Rpusd2Q149F1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33,45■■■□□ 2,95
Rpusd2Q149F1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,43■■■□□ 2,94
Rpusd2Q149F1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,41■■■□□ 2,94
Rpusd2Q149F1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,41■■■□□ 2,94
Rpusd2Q149F1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33,32■■■□□ 2,92
Rpusd2Q149F1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33,31■■■□□ 2,92
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