Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0K8

Vnn1, Pantetheinase, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vnn1Q9Z0K8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40,08■■■■■ 4,01
Vnn1Q9Z0K8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,87■■■■□ 3,81
Vnn1Q9Z0K8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,6■■■■□ 3,61
Vnn1Q9Z0K8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,46■■■■□ 3,59
Vnn1Q9Z0K8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36,7■■■■□ 3,47
Vnn1Q9Z0K8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36,29■■■■□ 3,4
Vnn1Q9Z0K8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,18■■■■□ 3,38
Vnn1Q9Z0K8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,87■■■■□ 3,33
Vnn1Q9Z0K8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35,74■■■■□ 3,31
Vnn1Q9Z0K8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,4■■■■□ 3,26
Vnn1Q9Z0K8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,25■■■■□ 3,23
Vnn1Q9Z0K8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35,2■■■■□ 3,23
Vnn1Q9Z0K8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,03■■■■□ 3,2
Vnn1Q9Z0K8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34,98■■■■□ 3,19
Vnn1Q9Z0K8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,95■■■■□ 3,19
Vnn1Q9Z0K8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,75■■■■□ 3,15
Vnn1Q9Z0K8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,69■■■■□ 3,14
Vnn1Q9Z0K8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,67■■■■□ 3,14
Vnn1Q9Z0K8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34,47■■■■□ 3,11
Vnn1Q9Z0K8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Vnn1Q9Z0K8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Vnn1Q9Z0K8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,24■■■■□ 3,07
Vnn1Q9Z0K8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Vnn1Q9Z0K8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Vnn1Q9Z0K8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,05
Vnn1Q9Z0K8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,02■■■■□ 3,04
Vnn1Q9Z0K8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33,98■■■■□ 3,03
Vnn1Q9Z0K8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
Vnn1Q9Z0K8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
Vnn1Q9Z0K8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,75■■■□□ 2,99
Vnn1Q9Z0K8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33,66■■■□□ 2,98
Vnn1Q9Z0K8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,64■■■□□ 2,98
Vnn1Q9Z0K8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,63■■■□□ 2,97
Vnn1Q9Z0K8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,63■■■□□ 2,97
Vnn1Q9Z0K8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,56■■■□□ 2,96
Vnn1Q9Z0K8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,51■■■□□ 2,96
Vnn1Q9Z0K8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33,48■■■□□ 2,95
Vnn1Q9Z0K8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33,36■■■□□ 2,93
Vnn1Q9Z0K8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Vnn1Q9Z0K8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,28■■■□□ 2,92
Vnn1Q9Z0K8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33,22■■■□□ 2,91
Vnn1Q9Z0K8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Vnn1Q9Z0K8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33,04■■■□□ 2,88
Vnn1Q9Z0K8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32,99■■■□□ 2,87
Vnn1Q9Z0K8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,94■■■□□ 2,86
Vnn1Q9Z0K8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32,93■■■□□ 2,86
Vnn1Q9Z0K8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,91■■■□□ 2,86
Vnn1Q9Z0K8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32,88■■■□□ 2,85
Vnn1Q9Z0K8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32,84■■■□□ 2,85
Vnn1Q9Z0K8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32,81■■■□□ 2,84
Vnn1Q9Z0K8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,59■■■□□ 2,81
Vnn1Q9Z0K8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,56■■■□□ 2,8
Vnn1Q9Z0K8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32,53■■■□□ 2,8
Vnn1Q9Z0K8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,3■■■□□ 2,76
Vnn1Q9Z0K8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,3■■■□□ 2,76
Vnn1Q9Z0K8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,22■■■□□ 2,75
Vnn1Q9Z0K8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,21■■■□□ 2,75
Vnn1Q9Z0K8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32,17■■■□□ 2,74
Vnn1Q9Z0K8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,12■■■□□ 2,73
Vnn1Q9Z0K8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,12■■■□□ 2,73
Vnn1Q9Z0K8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32,1■■■□□ 2,73
Vnn1Q9Z0K8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
Vnn1Q9Z0K8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,06■■■□□ 2,72
Vnn1Q9Z0K8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,03■■■□□ 2,72
Vnn1Q9Z0K8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,93■■■□□ 2,7
Vnn1Q9Z0K8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,92■■■□□ 2,7
Vnn1Q9Z0K8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
Vnn1Q9Z0K8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,9■■■□□ 2,7
Vnn1Q9Z0K8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,88■■■□□ 2,69
Vnn1Q9Z0K8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,88■■■□□ 2,69
Vnn1Q9Z0K8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31,85■■■□□ 2,69
Vnn1Q9Z0K8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31,81■■■□□ 2,68
Vnn1Q9Z0K8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,69■■■□□ 2,66
Vnn1Q9Z0K8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Vnn1Q9Z0K8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
Vnn1Q9Z0K8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,59■■■□□ 2,65
Vnn1Q9Z0K8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,58■■■□□ 2,65
Vnn1Q9Z0K8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31,58■■■□□ 2,65
Vnn1Q9Z0K8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,52■■■□□ 2,64
Vnn1Q9Z0K8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31,51■■■□□ 2,63
Vnn1Q9Z0K8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31,45■■■□□ 2,63
Vnn1Q9Z0K8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
Vnn1Q9Z0K8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31,36■■■□□ 2,61
Vnn1Q9Z0K8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,36■■■□□ 2,61
Vnn1Q9Z0K8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,36■■■□□ 2,61
Vnn1Q9Z0K8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,36■■■□□ 2,61
Vnn1Q9Z0K8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
Vnn1Q9Z0K8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Vnn1Q9Z0K8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,22■■■□□ 2,59
Vnn1Q9Z0K8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31,22■■■□□ 2,59
Vnn1Q9Z0K8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,21■■■□□ 2,59
Vnn1Q9Z0K8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,2■■■□□ 2,59
Vnn1Q9Z0K8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Vnn1Q9Z0K8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
Vnn1Q9Z0K8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Vnn1Q9Z0K8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Vnn1Q9Z0K8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Vnn1Q9Z0K8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
Vnn1Q9Z0K8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31,12■■■□□ 2,57
Vnn1Q9Z0K8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31,1■■■□□ 2,57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,1 ms