Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
Trip13Q3UA06 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Trip13Q3UA06 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Trip13Q3UA06 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Trip13Q3UA06 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Trip13Q3UA06 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Trip13Q3UA06 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Trip13Q3UA06 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Trip13Q3UA06 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Trip13Q3UA06 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Trip13Q3UA06 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Trip13Q3UA06 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Trip13Q3UA06 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Trip13Q3UA06 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Trip13Q3UA06 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Trip13Q3UA06 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Trip13Q3UA06 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Trip13Q3UA06 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Trip13Q3UA06 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Trip13Q3UA06 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Trip13Q3UA06 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Trip13Q3UA06 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Trip13Q3UA06 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Trip13Q3UA06 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Trip13Q3UA06 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Trip13Q3UA06 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Trip13Q3UA06 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Trip13Q3UA06 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Trip13Q3UA06 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Trip13Q3UA06 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Trip13Q3UA06 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Trip13Q3UA06 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Trip13Q3UA06 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Trip13Q3UA06 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Trip13Q3UA06 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Trip13Q3UA06 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Trip13Q3UA06 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Trip13Q3UA06 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Trip13Q3UA06 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Trip13Q3UA06 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
Trip13Q3UA06 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Trip13Q3UA06 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Trip13Q3UA06 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Trip13Q3UA06 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Trip13Q3UA06 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Trip13Q3UA06 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Trip13Q3UA06 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Trip13Q3UA06 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Trip13Q3UA06 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Trip13Q3UA06 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Trip13Q3UA06 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Trip13Q3UA06 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Trip13Q3UA06 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Trip13Q3UA06 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Trip13Q3UA06 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Trip13Q3UA06 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Trip13Q3UA06 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Trip13Q3UA06 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Trip13Q3UA06 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Trip13Q3UA06 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Trip13Q3UA06 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Trip13Q3UA06 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Trip13Q3UA06 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Trip13Q3UA06 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Trip13Q3UA06 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Trip13Q3UA06 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Trip13Q3UA06 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Trip13Q3UA06 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Trip13Q3UA06 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Trip13Q3UA06 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trip13Q3UA06 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Trip13Q3UA06 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Trip13Q3UA06 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Trip13Q3UA06 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Trip13Q3UA06 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trip13Q3UA06 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trip13Q3UA06 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Trip13Q3UA06 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trip13Q3UA06 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Trip13Q3UA06 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trip13Q3UA06 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Trip13Q3UA06 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Trip13Q3UA06 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trip13Q3UA06 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Trip13Q3UA06 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Trip13Q3UA06 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Trip13Q3UA06 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Trip13Q3UA06 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Trip13Q3UA06 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Trip13Q3UA06 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trip13Q3UA06 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trip13Q3UA06 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trip13Q3UA06 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trip13Q3UA06 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Trip13Q3UA06 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Trip13Q3UA06 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trip13Q3UA06 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Trip13Q3UA06 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Trip13Q3UA06 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trip13Q3UA06 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 265.7 ms