Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZN6

Gnptab, N-acetylglucosamine-1-phosphotransferase subunits alpha/beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GnptabQ69ZN6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC45.59■■■■■ 4.89
GnptabQ69ZN6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
GnptabQ69ZN6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
GnptabQ69ZN6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39.88■■■■□ 3.97
GnptabQ69ZN6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
GnptabQ69ZN6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
GnptabQ69ZN6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39■■■■□ 3.83
GnptabQ69ZN6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
GnptabQ69ZN6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
GnptabQ69ZN6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
GnptabQ69ZN6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
GnptabQ69ZN6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
GnptabQ69ZN6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
GnptabQ69ZN6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
GnptabQ69ZN6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
GnptabQ69ZN6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
GnptabQ69ZN6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
GnptabQ69ZN6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36.83■■■■□ 3.49
GnptabQ69ZN6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
GnptabQ69ZN6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
GnptabQ69ZN6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
GnptabQ69ZN6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
GnptabQ69ZN6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
GnptabQ69ZN6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
GnptabQ69ZN6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
GnptabQ69ZN6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
GnptabQ69ZN6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
GnptabQ69ZN6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
GnptabQ69ZN6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
GnptabQ69ZN6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
GnptabQ69ZN6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
GnptabQ69ZN6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
GnptabQ69ZN6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
GnptabQ69ZN6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
GnptabQ69ZN6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
GnptabQ69ZN6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
GnptabQ69ZN6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
GnptabQ69ZN6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
GnptabQ69ZN6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
GnptabQ69ZN6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
GnptabQ69ZN6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
GnptabQ69ZN6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
GnptabQ69ZN6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
GnptabQ69ZN6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
GnptabQ69ZN6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
GnptabQ69ZN6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
GnptabQ69ZN6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
GnptabQ69ZN6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
GnptabQ69ZN6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
GnptabQ69ZN6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
GnptabQ69ZN6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
GnptabQ69ZN6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
GnptabQ69ZN6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
GnptabQ69ZN6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
GnptabQ69ZN6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
GnptabQ69ZN6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
GnptabQ69ZN6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
GnptabQ69ZN6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
GnptabQ69ZN6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
GnptabQ69ZN6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
GnptabQ69ZN6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
GnptabQ69ZN6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
GnptabQ69ZN6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
GnptabQ69ZN6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
GnptabQ69ZN6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
GnptabQ69ZN6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
GnptabQ69ZN6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
GnptabQ69ZN6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
GnptabQ69ZN6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
GnptabQ69ZN6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
GnptabQ69ZN6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
GnptabQ69ZN6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
GnptabQ69ZN6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
GnptabQ69ZN6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
GnptabQ69ZN6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
GnptabQ69ZN6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
GnptabQ69ZN6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
GnptabQ69ZN6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.81■■■■□ 3
GnptabQ69ZN6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
GnptabQ69ZN6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
GnptabQ69ZN6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
GnptabQ69ZN6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
GnptabQ69ZN6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
GnptabQ69ZN6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
GnptabQ69ZN6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
GnptabQ69ZN6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
GnptabQ69ZN6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
GnptabQ69ZN6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
GnptabQ69ZN6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
GnptabQ69ZN6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
GnptabQ69ZN6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
GnptabQ69ZN6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
GnptabQ69ZN6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
GnptabQ69ZN6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
GnptabQ69ZN6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
GnptabQ69ZN6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
GnptabQ69ZN6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
GnptabQ69ZN6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
GnptabQ69ZN6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
GnptabQ69ZN6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms