Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC43.31■■■■■ 4.52
Atp1a4Q9WV27 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Atp1a4Q9WV27 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Atp1a4Q9WV27 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
Atp1a4Q9WV27 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
Atp1a4Q9WV27 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Atp1a4Q9WV27 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Atp1a4Q9WV27 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Atp1a4Q9WV27 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Atp1a4Q9WV27 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
Atp1a4Q9WV27 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
Atp1a4Q9WV27 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Atp1a4Q9WV27 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Atp1a4Q9WV27 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
Atp1a4Q9WV27 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Atp1a4Q9WV27 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Atp1a4Q9WV27 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Atp1a4Q9WV27 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Atp1a4Q9WV27 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Atp1a4Q9WV27 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Atp1a4Q9WV27 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Atp1a4Q9WV27 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
Atp1a4Q9WV27 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Atp1a4Q9WV27 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Atp1a4Q9WV27 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Atp1a4Q9WV27 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Atp1a4Q9WV27 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Atp1a4Q9WV27 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Atp1a4Q9WV27 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
Atp1a4Q9WV27 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Atp1a4Q9WV27 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Atp1a4Q9WV27 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Atp1a4Q9WV27 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Atp1a4Q9WV27 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Atp1a4Q9WV27 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Atp1a4Q9WV27 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Atp1a4Q9WV27 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Atp1a4Q9WV27 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Atp1a4Q9WV27 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Atp1a4Q9WV27 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Atp1a4Q9WV27 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Atp1a4Q9WV27 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Atp1a4Q9WV27 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Atp1a4Q9WV27 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Atp1a4Q9WV27 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Atp1a4Q9WV27 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Atp1a4Q9WV27 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Atp1a4Q9WV27 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Atp1a4Q9WV27 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Atp1a4Q9WV27 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
Atp1a4Q9WV27 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Atp1a4Q9WV27 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Atp1a4Q9WV27 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Atp1a4Q9WV27 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Atp1a4Q9WV27 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Atp1a4Q9WV27 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Atp1a4Q9WV27 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Atp1a4Q9WV27 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Atp1a4Q9WV27 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Atp1a4Q9WV27 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Atp1a4Q9WV27 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Atp1a4Q9WV27 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Atp1a4Q9WV27 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Atp1a4Q9WV27 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Atp1a4Q9WV27 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Atp1a4Q9WV27 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Atp1a4Q9WV27 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Atp1a4Q9WV27 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Atp1a4Q9WV27 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Atp1a4Q9WV27 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Atp1a4Q9WV27 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Atp1a4Q9WV27 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Atp1a4Q9WV27 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Atp1a4Q9WV27 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Atp1a4Q9WV27 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Atp1a4Q9WV27 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.69
Atp1a4Q9WV27 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Atp1a4Q9WV27 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Atp1a4Q9WV27 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Atp1a4Q9WV27 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Atp1a4Q9WV27 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Atp1a4Q9WV27 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Atp1a4Q9WV27 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Atp1a4Q9WV27 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Atp1a4Q9WV27 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Atp1a4Q9WV27 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Atp1a4Q9WV27 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Atp1a4Q9WV27 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Atp1a4Q9WV27 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Atp1a4Q9WV27 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Atp1a4Q9WV27 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Atp1a4Q9WV27 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Atp1a4Q9WV27 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Atp1a4Q9WV27 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Atp1a4Q9WV27 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Atp1a4Q9WV27 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
Atp1a4Q9WV27 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
Atp1a4Q9WV27 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Atp1a4Q9WV27 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Atp1a4Q9WV27 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms