Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39,93■■■■□ 3,98
Efhd1Q9D4J1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,15■■■■□ 3,7
Efhd1Q9D4J1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,07■■■■□ 3,52
Efhd1Q9D4J1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,88■■■■□ 3,49
Efhd1Q9D4J1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36,54■■■■□ 3,44
Efhd1Q9D4J1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,19■■■■□ 3,38
Efhd1Q9D4J1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35,65■■■■□ 3,3
Efhd1Q9D4J1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35,51■■■■□ 3,28
Efhd1Q9D4J1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,41■■■■□ 3,26
Efhd1Q9D4J1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34,97■■■■□ 3,19
Efhd1Q9D4J1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,84■■■■□ 3,17
Efhd1Q9D4J1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,7■■■■□ 3,15
Efhd1Q9D4J1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34,61■■■■□ 3,13
Efhd1Q9D4J1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,29■■■■□ 3,08
Efhd1Q9D4J1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Efhd1Q9D4J1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34,25■■■■□ 3,07
Efhd1Q9D4J1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,12■■■■□ 3,05
Efhd1Q9D4J1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
Efhd1Q9D4J1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3,03
Efhd1Q9D4J1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3,03
Efhd1Q9D4J1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,81■■■■□ 3
Efhd1Q9D4J1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,79■■■■□ 3
Efhd1Q9D4J1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,76■■■■□ 3
Efhd1Q9D4J1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,71■■■□□ 2,99
Efhd1Q9D4J1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33,68■■■□□ 2,98
Efhd1Q9D4J1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
Efhd1Q9D4J1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,66■■■□□ 2,98
Efhd1Q9D4J1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33,48■■■□□ 2,95
Efhd1Q9D4J1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,47■■■□□ 2,95
Efhd1Q9D4J1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,45■■■□□ 2,95
Efhd1Q9D4J1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,42■■■□□ 2,94
Efhd1Q9D4J1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33,38■■■□□ 2,93
Efhd1Q9D4J1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33,29■■■□□ 2,92
Efhd1Q9D4J1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,26■■■□□ 2,91
Efhd1Q9D4J1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
Efhd1Q9D4J1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
Efhd1Q9D4J1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,01■■■□□ 2,87
Efhd1Q9D4J1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,94■■■□□ 2,86
Efhd1Q9D4J1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,93■■■□□ 2,86
Efhd1Q9D4J1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32,83■■■□□ 2,85
Efhd1Q9D4J1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,79■■■□□ 2,84
Efhd1Q9D4J1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32,76■■■□□ 2,83
Efhd1Q9D4J1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32,71■■■□□ 2,83
Efhd1Q9D4J1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32,65■■■□□ 2,82
Efhd1Q9D4J1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32,59■■■□□ 2,81
Efhd1Q9D4J1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,56■■■□□ 2,8
Efhd1Q9D4J1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32,47■■■□□ 2,79
Efhd1Q9D4J1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32,45■■■□□ 2,79
Efhd1Q9D4J1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,44■■■□□ 2,78
Efhd1Q9D4J1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32,37■■■□□ 2,77
Efhd1Q9D4J1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,16■■■□□ 2,74
Efhd1Q9D4J1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,08■■■□□ 2,73
Efhd1Q9D4J1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,87■■■□□ 2,69
Efhd1Q9D4J1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31,83■■■□□ 2,69
Efhd1Q9D4J1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,82■■■□□ 2,69
Efhd1Q9D4J1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
Efhd1Q9D4J1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,74■■■□□ 2,67
Efhd1Q9D4J1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,66■■■□□ 2,66
Efhd1Q9D4J1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31,64■■■□□ 2,66
Efhd1Q9D4J1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31,63■■■□□ 2,65
Efhd1Q9D4J1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31,63■■■□□ 2,65
Efhd1Q9D4J1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,6■■■□□ 2,65
Efhd1Q9D4J1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31,59■■■□□ 2,65
Efhd1Q9D4J1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,54■■■□□ 2,64
Efhd1Q9D4J1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,53■■■□□ 2,64
Efhd1Q9D4J1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
Efhd1Q9D4J1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31,44■■■□□ 2,62
Efhd1Q9D4J1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
Efhd1Q9D4J1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31,38■■■□□ 2,61
Efhd1Q9D4J1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,37■■■□□ 2,61
Efhd1Q9D4J1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,35■■■□□ 2,61
Efhd1Q9D4J1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
Efhd1Q9D4J1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,25■■■□□ 2,59
Efhd1Q9D4J1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31,25■■■□□ 2,59
Efhd1Q9D4J1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Efhd1Q9D4J1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Efhd1Q9D4J1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31,21■■■□□ 2,59
Efhd1Q9D4J1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,21■■■□□ 2,59
Efhd1Q9D4J1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,2■■■□□ 2,59
Efhd1Q9D4J1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Efhd1Q9D4J1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Efhd1Q9D4J1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,58
Efhd1Q9D4J1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Efhd1Q9D4J1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31,05■■■□□ 2,56
Efhd1Q9D4J1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
Efhd1Q9D4J1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Efhd1Q9D4J1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Efhd1Q9D4J1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,55
Efhd1Q9D4J1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Efhd1Q9D4J1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,92■■■□□ 2,54
Efhd1Q9D4J1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Efhd1Q9D4J1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,85■■■□□ 2,53
Efhd1Q9D4J1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Efhd1Q9D4J1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Efhd1Q9D4J1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Efhd1Q9D4J1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30,78■■■□□ 2,52
Efhd1Q9D4J1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30,76■■■□□ 2,51
Efhd1Q9D4J1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,76■■■□□ 2,51
Efhd1Q9D4J1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,51
Efhd1Q9D4J1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30,67■■■□□ 2,5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26,7 ms