RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C CTL1Q03220 320 aaKnown RBP1.95□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C RSM28Q03430 361 aa1.95□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C EKI1Q03764 534 aa1.95□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C YLR352WQ06479 807 aa1.95□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C YML002WP0CF17 737 aa1.94□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C CHS3P29465 1165 aa1.94□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C PDR3P33200 976 aa1.94□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C MUD2P36084 527 aaKnown RBP1.94□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C YEL068CP39977 110 aa1.94□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C SLZ1P40167 298 aa1.94□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C SEC24P40482 926 aaKnown RBP1.94□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C SGF73P53165 657 aa1.94□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C PIL1P53252 339 aaKnown RBP1.94□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C BSC5P53755 489 aa1.94□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C SUB1P54000 292 aaKnown RBP1.94□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C PFA5Q03289 374 aa1.94□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C ENT4Q07872 247 aa1.94□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C DAP1Q12091 152 aa1.94□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C BSC1Q12140 328 aa1.94□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C SKM1Q12469 655 aa1.94□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C YBR085C-AO43137 85 aa1.94□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C KRS1P15180 591 aaKnown RBP1.94□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C GFD2P25370 566 aaKnown RBP1.94□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C GID7P25569 745 aa1.94□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C GAC1P28006 793 aa1.94□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C LOS1P33418 1100 aaPredicted RBP1.94□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C PHO90P39535 881 aa1.94□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C ECM10P39987 644 aa1.94□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C GUF1P46943 645 aa1.94□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C SIP4P46954 829 aa1.94□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C YTP1P53584 459 aa1.94□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C INN1P53901 409 aa1.94□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C CRZ1P53968 678 aa1.94□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C YMR178WQ03219 274 aaKnown RBP1.94□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C VIP1Q06685 1146 aaKnown RBP1.94□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C TLG2Q08144 397 aa1.94□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C YDR056CQ12025 205 aa1.94□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C CDC16P09798 840 aa1.93□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C CDC24P11433 854 aaPredicted RBP1.93□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C SWE1P32944 819 aa1.93□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C SPC34P36131 295 aa1.93□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C ESL2P36168 1195 aa1.93□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C RIM2P38127 377 aa1.93□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C DHH1P39517 506 aaKnown RBP1.93□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C RGI2P40188 164 aa1.93□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C LYS14P40971 790 aa1.93□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C YFR020WP43600 232 aa1.93□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C ARC1P46672 376 aaKnown RBP1.93□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C AAD10P47182 288 aa1.93□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C SKG3Q06315 1026 aa1.93□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C EDE1P34216 1381 aa1.93□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C RAP1P11938 827 aa1.92□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C YBR139WP38109 508 aa1.92□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C IST1P53843 298 aaPredicted RBP1.92□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C YSA1Q01976 231 aa1.92□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C NUP100Q02629 959 aa1.92□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C RAD30Q04049 632 aa1.92□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C HCR1Q05775 265 aaKnown RBP1.92□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C RIX7Q07844 837 aaKnown RBP1.92□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C ENT1Q12518 454 aa1.92□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C HXK2P04807 486 aaKnown RBP1.92□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C RPL19AP0CX82 189 aaKnown RBP1.92□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C RPL19BP0CX83 189 aaPredicted RBP1.92□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C MRS3P10566 314 aa1.92□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C PRP16P15938 1071 aaPredicted RBP1.92□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C GLN3P18494 730 aa1.92□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C SAN1P22470 610 aa1.92□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C PRE8P23639 250 aa1.92□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C PAH1P32567 862 aa1.92□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C MIA40P36046 403 aa1.92□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C RFC1P38630 861 aaKnown RBP1.92□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C RTS1P38903 757 aa1.92□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C KRE9P39005 276 aa1.92□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C YER130CP39959 443 aa1.92□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C BUR6P40096 142 aa1.92□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C TMA108P40462 946 aa1.92□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C YNL234WP53857 426 aa1.92□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C INA17Q02888 182 aa1.92□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C YKU80Q04437 629 aa1.92□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C YOL159CQ08300 171 aa1.92□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C AAC3P18238 307 aa1.91□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C MAL33P38157 468 aa1.91□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C NOP16P40007 231 aaKnown RBP1.91□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C PKP1P40530 394 aa1.91□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C DPB11P47027 764 aaPredicted RBP1.91□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C RPS7BP48164 190 aaKnown RBP1.91□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C PKP2P53170 491 aa1.91□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C NNF2P53253 936 aa1.91□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C PSR1Q07800 427 aa1.91□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C TCO89Q08921 799 aa1.91□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C ATG9Q12142 997 aa1.91□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C YBR126W-AQ8TGU7 68 aa1.91□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C YCK1P23291 538 aa1.9□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C PDB1P32473 366 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C YBL029WP38201 376 aa1.9□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C DED81P38707 554 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C YNG2P38806 282 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C YIL060WP40519 144 aa1.9□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C DIM1P41819 318 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.1
HDA3YPR179C ROK1P45818 564 aaPredicted RBP1.9□□□□□ -2.1
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