RNA–Protein interactions for RNA: YPR069C

SPE3, Transcript of Spermidine synthase, yeastyeast

Gene SPE3, Length 882 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3YPR069C FUR1P18562 216 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C HSP60P19882 572 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C MSB1P21339 1137 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C LDB16P25587 256 aa6.85□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C PET309P32522 965 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C LRG1P35688 1017 aa6.85□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C YPT52P36018 234 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C HSE1P38753 452 aa6.85□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C MTG2P38860 518 aa6.85□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C YHR182WP38870 785 aa6.85□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C OSW7P43611 510 aa6.85□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C PET130P47065 347 aa6.85□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C NNF1P47149 201 aa6.85□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C PMT3P47190 753 aa6.85□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C BOP3P53958 396 aa6.85□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C NHX1Q04121 633 aa6.85□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C YMR114CQ04471 368 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C CDC73Q06697 393 aa6.85□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C HSP42Q12329 375 aa6.85□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C HRP1Q99383 534 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C SPS1P08458 490 aa6.84□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C PRP2P20095 876 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C YCL068CP25593 260 aa6.84□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C RSC6P25632 483 aa6.84□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C MVD1P32377 396 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C MF(ALPHA)2P32435 120 aa6.84□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C TIP20P33891 701 aa6.84□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C TOM20P35180 183 aa6.84□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C EBP2P36049 427 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C YHR020WP38708 688 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C YHL008CP38750 627 aa6.84□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C DMA1P38823 416 aa6.84□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C MEF2P39677 819 aa6.84□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C ASK10P48361 1146 aa6.84□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C CTK1Q03957 528 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C TRM12Q04235 462 aa6.84□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C RRP45Q05636 305 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C VAC14Q06708 880 aa6.84□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C YML002WP0CF17 737 aa6.83□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C HOP1P20050 605 aa6.83□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C IMG1P25626 169 aa6.83□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C YCR099CP25657 155 aa6.83□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C GCD6P32501 712 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C CYM1P32898 989 aa6.83□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C FMP46P36141 133 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C POP4P38336 279 aa6.83□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C YHR045WP38775 560 aa6.83□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C RPC17P47076 161 aa6.83□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C RPL22BP56628 122 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C ECI1Q05871 280 aa6.83□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C LEU9Q12166 604 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C YOL107WQ12239 342 aa6.83□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C BMT6Q12291 365 aa6.83□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C GPR1Q12361 961 aa6.83□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C ZRT2Q12436 422 aa6.83□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C LAG2Q92325 660 aa6.83□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C GLT1Q12680 2145 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C ERG20P08524 352 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C ILS1P09436 1072 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C SIN4P32259 974 aa6.82□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C GDA1P32621 518 aa6.82□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C THI80P35202 319 aa6.82□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C DEF1P35732 738 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C VHC1P38329 1120 aa6.82□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C PFA3P42836 336 aa6.82□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C SPP2Q02521 185 aa6.82□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C SSL1Q04673 461 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C RSC3Q06639 885 aa6.82□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C PNS1Q12412 539 aa6.82□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C PHO5P00635 467 aa6.81□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C GAL7P08431 366 aa6.81□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C NSP1P14907 823 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C HSP26P15992 214 aaKnown RBP RIP-Chip data6.81□□□□□ -1.32not detected
SPE3YPR069C PRI2P20457 528 aa6.81□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C ATP12P22135 325 aa6.81□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C MGT1P26188 188 aa6.81□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C CDC20P26309 610 aa6.81□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C URA10P30402 227 aa6.81□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C RRP1P35178 278 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C RIM11P38615 370 aa6.81□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C GAT1P43574 510 aa6.81□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C YFL012WP43580 148 aa6.81□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C YJL049WP47048 450 aa6.81□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C CWC22P53333 577 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C ESF2P53743 316 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C CUE5Q08412 411 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C GYP1Q08484 637 aa6.81□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C MSL5Q12186 476 aaKnown RBP RIP-Chip data6.81□□□□□ -1.32not detected
SPE3YPR069C IPP1P00817 287 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C AI4P03878 556 aa6.8□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C BCY1P07278 416 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C YAR066WP0CX18 203 aa6.8□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C YHR214WP0CX19 203 aa6.8□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C PHO3P24031 467 aa6.8□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C BUB3P26449 341 aa6.8□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C ATP11P32453 318 aa6.8□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C MGM101P32787 269 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C SKT5P34226 696 aa6.8□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C MRPL15P36523 253 aa6.8□□□□□ -1.32
SPE3YPR069C BEM4P39011 633 aa6.8□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23.1 ms