RNA–Protein interactions for RNA: YPR013C

CMR3, Transcript of Putative zinc finger protein, yeast

Gene CMR3, Length 954 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CMR3	YPR013C	RLM1	Q12224	676 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CMR3	YPR013C	SEC39	Q12745	709 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CMR3	YPR013C	ISN1	Q99312	450 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CMR3	YPR013C	HCM1	P25364	564 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CMR3	YPR013C	PRD1	P25375	712 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CMR3	YPR013C	ERV1	P27882	189 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CMR3	YPR013C	BRF1	P29056	596 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CMR3	YPR013C	YBR144C	P34215	104 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CMR3	YPR013C	PCL5	P38794	229 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CMR3	YPR013C	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CMR3	YPR013C	ECM10	P39987	644 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CMR3	YPR013C	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CMR3	YPR013C	YGR127W	P53275	312 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CMR3	YPR013C	IPI3	P53877	555 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CMR3	YPR013C	EOS1	P53938	366 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CMR3	YPR013C	KAP120	Q02932	1032 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CMR3	YPR013C	PLM2	Q04383	521 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CMR3	YPR013C	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CMR3	YPR013C	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CMR3	YPR013C	INP53	Q12271	1107 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CMR3	YPR013C	GPM3	Q12326	303 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CMR3	YPR013C	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CMR3	YPR013C	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CMR3	YPR013C	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	PKP1	P40530	394 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	CUL3	P53202	744 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	WAR1	Q03631	944 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	RAD33	Q04231	177 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	SOV1	Q04748	898 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	YOL073C	Q08232	322 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	NFI1	Q12216	726 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	FRE6	Q12473	712 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	SKS1	Q12505	502 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	CTF3	Q12748	733 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	YML133C	Q03099	1374 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	YLL067C	Q07888	1374 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	YLL066C	Q99208	1374 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	STF1	P01098	86 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	SPE2	P21182	396 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	BUD14	P27637	709 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	HCS1	P34243	683 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	SWH1	P35845	1188 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	YHL017W	P38745	532 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	PES4	P39684	611 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	SMC3	P47037	1230 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	RSF1	Q05043	376 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	DON1	Q05610	365 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	ATG9	Q12142	997 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	SGS1	P35187	1447 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	MRP13	P12686	339 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	IMG1	P25626	169 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	PTC6	P25646	442 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	YME1	P32795	747 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	THI80	P35202	319 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	YHR054C	P38780	354 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	ELO1	P39540	310 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	BDH2	P39713	417 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	UBP5	P39944	805 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	EFM4	P40516	257 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	PTR3	P43606	678 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	STB2	P46679	850 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	GPI8	P49018	411 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	CPR8	P53728	308 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	YPL107W	Q02873	248 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	PCL8	Q08966	492 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	TAF3	Q12297	353 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	GSH1	P32477	678 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	YME2	P32843	850 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	NIP100	P33420	868 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	ICS2	P38284	255 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	OPT1	P40897	799 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	YFR020W	P43600	232 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	SAE2	P46946	345 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CMR3	YPR013C	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69

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