RNA–Protein interactions for RNA: YNL242W

ATG2, Transcript of Peripheral membrane protein required for autophagic vesicle formation, yeast

Gene ATG2, Length 4,779 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG2	YNL242W	TAF11	Q04226	346 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	RSC58	Q07979	502 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	ZEO1	Q08245	113 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	ACF2	Q12168	779 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	SRF1	Q12516	437 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	YIL177C	P40434	1758 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	YJL225C	P40889	1758 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	FKS3	Q04952	1785 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	WHI2	P12611	486 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	RGT1	P32862	1170 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	TIR3	P40552	269 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	REF2	P42073	533 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	NCS6	P53088	359 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	ARK1	P53974	638 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	ARP10	Q04549	284 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	SHS1	Q07657	551 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	HUA2	Q12134	243 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	FMP16	Q12497	93 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	MSS18	P08593	268 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	SSO1	P32867	290 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	TFA2	P36145	328 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	ARA1	P38115	344 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	FMO1	P38866	432 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	HXT7	P39004	570 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	YIL077C	P40508	320 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	VPS70	P47161	811 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	MPS1	P54199	764 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	YML037C	Q03703	340 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.98	□□□□□ -1.77	not detected
ATG2	YNL242W	ICL2	Q12031	575 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	STE3	P06783	470 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	YIH1	P25637	258 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	NIC96	P34077	839 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	MEF2	P39677	819 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	MTW1	P39731	289 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	SPO74	P45819	413 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	RPL17B	P46990	184 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	AVT1	P47082	602 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	TAH11	P47112	604 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	YNL115C	P53925	644 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	ORC4	P54791	529 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	SKY1	Q03656	742 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	SET3	P36124	751 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	YKR075C	P36155	307 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	MCM7	P38132	845 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	KRE29	P40026	464 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	GID8	P40208	455 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	MRPS18	P42847	217 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	AZR1	P50080	613 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	LIF1	P53150	421 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	MAK3	Q03503	176 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	YMR155W	Q03795	547 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	THI7	Q05998	598 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	CRN1	Q06440	651 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	YLR031W	Q07978	186 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	APC5	Q08683	685 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	RTR2	Q12378	196 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	ABF1	P14164	731 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	DAP2	P18962	818 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	MRPL33	P20084	86 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	PEX1	P24004	1043 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	SLX5	P32828	619 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	MRPL17	P36528	281 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	CYC2	P38909	366 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	GIP4	P39732	760 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	SER3	P40054	469 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	EMP65	P40085	556 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	YER186C	P40101	306 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	FIG4	P42837	879 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	NET1	P47035	1189 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	BIO3	P50277	480 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	YGR127W	P53275	312 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	BRE4	Q07660	1125 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	KCS1	Q12494	1050 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	RHO2	P06781	192 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	MAS2	P11914	482 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	MRPL36	P36531	177 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	YBR259W	P38338	688 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	SAP4	P53036	818 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	HSP31	Q04432	237 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	MDM32	Q12171	622 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	ARG81	P05085	880 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	CTP1	P38152	299 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG2	YNL242W	HSE1	P38753	452 aa		3.97	□□□□□ -1.77

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 54.1 ms