RNA–Protein interactions for RNA: YMR028W

TAP42, Transcript of Essential protein involved in the TOR signaling pathway, yeast

Gene TAP42, Length 1,101 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TAP42	YMR028W	ARP6	Q12509	438 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TAP42	YMR028W	NUC1	P08466	329 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TAP42	YMR028W	ATS1	P31386	333 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TAP42	YMR028W	ACH1	P32316	526 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TAP42	YMR028W	MIA40	P36046	403 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TAP42	YMR028W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
TAP42	YMR028W	MRPL36	P36531	177 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TAP42	YMR028W	SRO77	P38163	1010 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TAP42	YMR028W	NPR3	P38742	1146 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TAP42	YMR028W	ECM10	P39987	644 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TAP42	YMR028W	YTA12	P40341	825 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TAP42	YMR028W	IDP2	P41939	412 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TAP42	YMR028W	PKP2	P53170	491 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TAP42	YMR028W	RTS3	P53289	263 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TAP42	YMR028W	STP3	Q05937	343 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TAP42	YMR028W	CRN1	Q06440	651 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TAP42	YMR028W	VAM6	Q07468	1049 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TAP42	YMR028W	YEL045C	P32616	141 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TAP42	YMR028W	NUP120	P35729	1037 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TAP42	YMR028W	IES5	P40060	125 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TAP42	YMR028W	MRPL13	Q02204	264 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TAP42	YMR028W	ATG16	Q03818	150 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TAP42	YMR028W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
TAP42	YMR028W	MTF2	P10849	440 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TAP42	YMR028W	SPO16	P17122	198 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TAP42	YMR028W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
TAP42	YMR028W	SAP185	P40856	1058 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TAP42	YMR028W	MSS11	Q03825	758 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TAP42	YMR028W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
TAP42	YMR028W	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
TAP42	YMR028W	COX17	Q12287	69 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TAP42	YMR028W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TAP42	YMR028W	NDC1	P32500	655 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TAP42	YMR028W	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TAP42	YMR028W	IFA38	P38286	347 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TAP42	YMR028W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TAP42	YMR028W	SMK1	P41808	388 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TAP42	YMR028W	RSM28	Q03430	361 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TAP42	YMR028W	RBA50	Q04418	439 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TAP42	YMR028W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TAP42	YMR028W	FMP45	Q07651	309 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TAP42	YMR028W	PCD1	Q12524	340 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TAP42	YMR028W	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	SPC110	P32380	944 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	XRS2	P33301	854 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	ARP1	P38696	384 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	SWP82	P43554	623 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	YGR021W	P53212	290 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	SOL4	P53315	255 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	TFC6	Q06339	672 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	GRC3	Q07845	632 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	CDC45	Q08032	650 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	TPK1	P06244	397 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	FUI1	P38196	639 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	CTF18	P49956	741 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	ASE1	P50275	885 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	COG1	P53079	417 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	ATG26	Q06321	1198 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	SSM4	P40318	1319 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	TY2A-F	P0CX61	438 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	PMR1	P13586	950 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	TYR1	P20049	452 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	TY2A-C	P25383	438 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	RAD16	P31244	790 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	PSY4	P38193	441 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	AXL1	P40851	1208 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	YFR020W	P43600	232 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	SDT1	P53078	280 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	GTR1	Q00582	310 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	TMA16	Q08687	178 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	TY2A-B	Q12260	438 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.12	□□□□□ -1.91	not detected
TAP42	YMR028W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	BNA1	P47096	177 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	YGL082W	P53155	381 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	TRM8	Q12009	286 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	AYT1	Q12226	474 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	PTR2	P32901	601 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	UME6	P39001	836 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	BTN2	P53286	410 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	VID22	Q05934	901 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	RDR1	Q08904	546 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
TAP42	YMR028W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91

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