RNA–Protein interactions for RNA: YLR346C

YLR346C, Transcript of Putative protein of unknown function found in mitochondria, yeast

Gene YLR346C, Length 306 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR346C	YLR346C	YFT2	Q06676	274 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLR346C	YLR346C	YLL007C	Q07799	665 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLR346C	YLR346C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YLR346C	YLR346C	MSH5	Q12175	901 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLR346C	YLR346C	TIP41	Q12199	356 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLR346C	YLR346C	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
YLR346C	YLR346C	PDC1	P06169	563 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	DSF1	P0CX08	502 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	YNR073C	P0CX09	502 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	ADH4	P10127	382 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	UGA1	P17649	471 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	COQ1	P18900	473 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	APA2	P22108	325 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	YCK1	P23291	538 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	NAM9	P27929	486 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	NDI1	P32340	513 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	GEX2	P36173	615 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	AGP2	P38090	596 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	CDS1	P38221	457 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	SHU2	P38957	223 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	FHL1	P39521	936 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	YGL117W	P53133	265 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	YGL114W	P53134	725 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	DIA1	P54005	336 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	GCR2	Q01722	534 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	FMP30	Q02883	468 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	DFG5	Q05031	458 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	MET7	Q08645	548 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	BTS1	Q12051	335 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	SEY1	Q99287	776 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	RAD9	P14737	1309 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
YLR346C	YLR346C	ATP12	P22135	325 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	GIT1	P25346	518 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	HCS1	P34243	683 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	YER184C	P39961	794 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	JLP2	P40206	208 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	ICE2	P40499	491 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	PCI8	P40512	444 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	YHC3	P47040	408 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	NIT3	P49954	291 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	YKE2	P52553	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	COG2	P53271	262 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	MRPL50	P53724	139 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	GOR1	P53839	350 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	RMI1	Q02685	241 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	YPL062W	Q02781	134 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	YML108W	Q03759	105 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	THI22	Q06490	572 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	YDL144C	Q07589	356 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	TRE1	Q08919	783 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	YPL066W	Q12194	479 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	NTO1	Q12311	748 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	SSN2	P38931	1420 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	MDS3	P53094	1487 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	SNF6	P18888	332 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	MSN1	P22148	382 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	RHB1	P25378	209 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	PER1	P25625	357 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	PPA2	P28239	310 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	NTH1	P32356	751 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	AST1	P35183	429 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	EMC3	P36039	253 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	MRPL4	P36517	319 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	FIG1	P38224	298 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	FAT1	P38225	669 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	RRT2	P38332	387 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	END3	P39013	349 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	YEL057C	P39983	233 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	EAF5	P39995	279 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	RGI2	P40188	164 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	RRT14	P40470	206 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	MET28	P40573	187 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR346C	YLR346C	EFM3	P47163	339 aa		4.88	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 60.1 ms