RNA–Protein interactions for RNA: YJL004C

SYS1, Transcript of Integral membrane protein of the Golgi, yeast

Gene SYS1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYS1	YJL004C	CBS2	P14905	389 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SYS1	YJL004C	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
SYS1	YJL004C	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
SYS1	YJL004C	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
SYS1	YJL004C	HXT9	P40885	567 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SYS1	YJL004C	AZF1	P41696	914 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SYS1	YJL004C	FET5	P43561	622 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SYS1	YJL004C	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
SYS1	YJL004C	PET111	P08468	800 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	SAN1	P22470	610 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	NUP120	P35729	1037 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	MDM31	P38880	579 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	RGI2	P40188	164 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	YJL068C	P40363	299 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	STP3	Q05937	343 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	TLG2	Q08144	397 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	SNT2	P53127	1403 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	EXO84	P38261	753 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	RTS1	P38903	757 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	SHE10	P53075	577 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	CRN1	Q06440	651 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	YDL218W	Q07629	317 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	IQG1	Q12280	1495 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	SPO14	P36126	1683 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	NTE1	Q04958	1679 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	CAT8	P39113	1433 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	MSP1	P28737	362 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	AVT5	P38176	459 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	ERG7	P38604	731 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	ERR3	P42222	437 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	MAK10	Q02197	733 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	VAM6	Q07468	1049 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	CDC25	P04821	1589 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	MDS3	P53094	1487 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	GAC1	P28006	793 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	SPC110	P32380	944 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	YKL133C	P36066	463 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	GEX2	P36173	615 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	ECM10	P39987	644 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	SMC3	P47037	1230 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	YTP1	P53584	459 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	TRS130	Q03660	1102 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	CDC45	Q08032	650 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	MLP1	Q02455	1875 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	DNF3	Q12674	1656 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	PHO90	P39535	881 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	YBP1	P38315	674 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	GUF1	P46943	645 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	ASE1	P50275	885 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	TGL2	P54857	326 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	RSM28	Q03430	361 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	NUP192	P47054	1683 aa		3.15	□□□□□ -1.9
SYS1	YJL004C	TFC3	P34111	1160 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SYS1	YJL004C	MIA40	P36046	403 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SYS1	YJL004C	YJL132W	P47014	750 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SYS1	YJL004C	BOR1	P53838	576 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SYS1	YJL004C	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SYS1	YJL004C	NUP100	Q02629	959 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SYS1	YJL004C	YEH2	Q07950	538 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SYS1	YJL004C	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SYS1	YJL004C	MPD2	Q99316	277 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SYS1	YJL004C	MET5	P47169	1442 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SYS1	YJL004C	IML1	P47170	1584 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SYS1	YJL004C	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SYS1	YJL004C	SWH1	P35845	1188 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SYS1	YJL004C	SPC34	P36131	295 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SYS1	YJL004C	MRPL36	P36531	177 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SYS1	YJL004C	FAA2	P39518	744 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SYS1	YJL004C	SPC72	P39723	622 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SYS1	YJL004C	SWP82	P43554	623 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SYS1	YJL004C	YDL186W	P48568	277 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SYS1	YJL004C	YGL242C	P53066	181 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SYS1	YJL004C	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SYS1	YJL004C	PDS5	Q04264	1277 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SYS1	YJL004C	MLC2	Q06580	163 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SYS1	YJL004C	YLL056C	Q12177	298 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SYS1	YJL004C	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SYS1	YJL004C	LTE1	P07866	1435 aa		3.13	□□□□□ -1.91

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