RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547701.5

CTDSP2-203, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-203ENST00000547701 INHAP05111 366 aa27.41■■□□□ 1.98
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CTDSP2-203ENST00000547701 TRIB2Q92519 343 aa27.41■■□□□ 1.98
CTDSP2-203ENST00000547701 TEX13BQ9BXU2 312 aa27.41■■□□□ 1.98
CTDSP2-203ENST00000547701 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
CTDSP2-203ENST00000547701 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa27.4■■□□□ 1.98
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CTDSP2-203ENST00000547701 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa27.37■■□□□ 1.97
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CTDSP2-203ENST00000547701 PRR12Q9ULL5 1215 aa27.33■■□□□ 1.97
CTDSP2-203ENST00000547701 RIPK3Q9Y572 518 aa27.33■■□□□ 1.97
CTDSP2-203ENST00000547701 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa27.32■■□□□ 1.96
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CTDSP2-203ENST00000547701 CCL14Q16627 93 aa27.32■■□□□ 1.96
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CTDSP2-203ENST00000547701 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa27.32■■□□□ 1.96
CTDSP2-203ENST00000547701 PNMA1Q8ND90 353 aa27.32■■□□□ 1.96
CTDSP2-203ENST00000547701 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
CTDSP2-203ENST00000547701 SHISA4Q96DD7 197 aa27.32■■□□□ 1.96
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CTDSP2-203ENST00000547701 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
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CTDSP2-203ENST00000547701 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
CTDSP2-203ENST00000547701 FLRT1Q9NZU1 646 aa27.31■■□□□ 1.96
CTDSP2-203ENST00000547701 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
CTDSP2-203ENST00000547701 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
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CTDSP2-203ENST00000547701 MFSD14CQ5VZR4 134 aa27.3■■□□□ 1.96
CTDSP2-203ENST00000547701 CYB5R4Q7L1T6 521 aa27.3■■□□□ 1.96
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CTDSP2-203ENST00000547701 SMCHD1A6NHR9 2005 aa27.29■■□□□ 1.96
CTDSP2-203ENST00000547701 TSGA10IPQ3SY00 556 aa27.29■■□□□ 1.96
CTDSP2-203ENST00000547701 STOX1Q6ZVD7 989 aa27.29■■□□□ 1.96
CTDSP2-203ENST00000547701 MAML3Q96JK9 1138 aa27.29■■□□□ 1.96
CTDSP2-203ENST00000547701 KAT14Q9H8E8 782 aa27.29■■□□□ 1.96
CTDSP2-203ENST00000547701 ICAM1P05362 532 aa27.28■■□□□ 1.96
CTDSP2-203ENST00000547701 CCDC96Q2M329 555 aa27.28■■□□□ 1.96
CTDSP2-203ENST00000547701 SYDE2Q5VT97 1194 aa27.28■■□□□ 1.96
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