RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000387416.2

MT-TS1-201, Transcript of mitochondrially encoded tRNA serine 1 (UCN), humanhuman

BASIC

Gene MT-TS1, Length 69 nt, Biotype Mt tRNA, Subcellular localisation Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-TS1-201ENST00000387416 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP10.02□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa10.02□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 FBXO28Q9NVF7 368 aa10.02□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 PLXNB2O15031 1838 aa10.01□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 PARP14Q460N5 1801 aa10.01□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 MSCO60682 206 aa10.01□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 TFRCP02786 760 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 MCCP23508 829 aa10.01□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 ADORA2AP29274 412 aa10.01□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 TRDNQ13061 729 aa10.01□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 TKFCQ3LXA3 575 aa10.01□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 BMP2KLQ5H9B9 411 aa10.01□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 ERICH6BQ5W0A0 696 aa10.01□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa10.01□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP10.01□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 CHST13Q8NET6 341 aa10.01□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 REPS2Q8NFH8 660 aa10.01□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 ANKS1AQ92625 1134 aa10.01□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 KIFC2Q96AC6 838 aa10.01□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 CCDC136Q96JN2 1154 aa10.01□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 DEFB118Q96PH6 123 aa10.01□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 HTATIP2Q9BUP3 242 aa10.01□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 INCENPQ9NQS7 918 aa10.01□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 NRBP1Q9UHY1 535 aa10.01□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 A0A0G2JMZ2 1700 aa10.01□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 CENPFP49454 3210 aa10□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 SGSM2O43147 1006 aa10□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 IKQ13123 557 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 BTNL9Q6UXG8 535 aa10□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 TBC1D10CQ8IV04 446 aa10□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 MMP19Q99542 508 aa10□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM47Q9BQJ4 181 aa10□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 NBPF3Q9H094 633 aa10□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 TACC3Q9Y6A5 838 aa10□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF236Q9UL36 1845 aa10□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 NMT2O60551 498 aa9.99□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 KDM4AO75164 1064 aa9.99□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 IGHA2P01877 340 aa9.99□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 CASC1Q6TDU7 716 aa9.99□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 CPXCR1Q8N123 301 aa9.99□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 DDX11Q96FC9 970 aa9.99□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 UBAC1Q9BSL1 405 aa9.99□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 MAF1Q9H063 256 aa9.99□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 OGDHLQ9ULD0 1010 aa9.99□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 COBLO75128 1261 aa9.98□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 SNHG28P0DPA3 235 aa9.98□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 CCL14Q16627 93 aa9.98□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 CCDC96Q2M329 555 aa9.98□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF792Q3KQV3 632 aa9.98□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 KCTD1Q719H9 257 aa9.98□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 NECAB2Q7Z6G3 386 aa9.98□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa9.98□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 NPLOC4Q8TAT6 608 aa9.98□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 MAP4K1Q92918 833 aa9.98□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 SHISA4Q96DD7 197 aa9.98□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 KAT14Q9H8E8 782 aa9.98□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 ZSWIM5Q9P217 1185 aa9.98□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 NR2E3Q9Y5X4 410 aa9.98□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 ERICH2A1L162 156 aa9.97□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 B4E1Z4 1266 aa9.97□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF543Q08ER8 600 aa9.97□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 TRIM32Q13049 653 aa9.97□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 SART3Q15020 963 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 SYDE2Q5VT97 1194 aa9.97□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 ANKRD35Q8N283 1001 aa9.97□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 ARRDC4Q8NCT1 418 aa9.97□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 MAML3Q96JK9 1138 aa9.97□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 TINF2Q9BSI4 451 aa9.97□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 MTA3Q9BTC8 594 aa9.97□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 ACAD9Q9H845 621 aa9.97□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 PRR12Q9ULL5 1215 aa9.97□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 LAMA4Q16363 1823 aa9.97□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 PFASO15067 1338 aa9.97□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 NEDD4P46934 1319 aa9.97□□□□□ -0.81
MT-TS1-201ENST00000387416 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa9.96□□□□□ -0.82
MT-TS1-201ENST00000387416 SEPT4O43236 478 aa9.96□□□□□ -0.82
MT-TS1-201ENST00000387416 ICAM1P05362 532 aa9.96□□□□□ -0.82
MT-TS1-201ENST00000387416 CYP21A2P08686 494 aa9.96□□□□□ -0.82
MT-TS1-201ENST00000387416 PDHBP11177 359 aa9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms