RNA–Protein interactions for RNA: YOR115C

TRS33, Transcript of Core component of transport protein particle (TRAPP) complexes I-III, yeast

Gene TRS33, Length 807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRS33	YOR115C	VPS54	Q12071	889 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	AVL9	Q12500	764 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	PCD1	Q12524	340 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	MOT1	P32333	1867 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	REC107	P21651	314 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	MRE11	P32829	692 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	YHR054C	P38780	354 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	PEX7	P39108	375 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	YJL107C	P42947	387 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	YFL012W	P43580	148 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	TAF1	P46677	1066 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	STB4	P50104	949 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	PCL10	P53124	433 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	USE1	P53146	245 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	YNL144C	P53907	740 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	APM4	Q99186	491 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	LAA1	P39526	2014 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	IMA3	P0CW40	589 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	IMA4	P0CW41	589 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	POX1	P13711	748 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	GLN3	P18494	730 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	TOA1	P32773	286 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	FRE1	P32791	686 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	AIM26	P32858	118 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	RGT1	P32862	1170 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	RRN3	P36070	627 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	YMC2	P38087	329 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	HSL7	P38274	827 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	HXT7	P39004	570 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	YJL206C	P39529	758 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	ERP2	P39704	215 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	RRT5	P43607	289 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	RET2	P43621	546 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	YJR054W	P47114	497 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	SLG1	P54867	378 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	MET14	Q02196	202 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	OSH6	Q02201	448 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	ECM9	Q02202	377 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	GTB1	Q04924	702 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	IMA2	Q08295	589 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	THI21	Q08975	551 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	GPM3	Q12326	303 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	ATG11	Q12527	1178 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	VPS5	Q92331	675 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	MPD2	Q99316	277 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	IZH4	Q99393	312 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	SNT1	P25357	1226 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	YCL002C	P25565	263 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	HSP78	P33416	811 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	SIC1	P38634	284 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	YER186C	P40101	306 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	CHS6	P40955	746 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	FAR3	P46671	204 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	MAD3	P47074	515 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	YGR127W	P53275	312 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	MUB1	Q03162	620 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	MSC2	Q03455	724 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	YMR209C	Q03648	457 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	SIZ1	Q04195	904 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	YLL056C	Q12177	298 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	SVS1	Q12254	260 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	SPE4	Q12455	300 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	SEC39	Q12745	709 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	CTF3	Q12748	733 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	DFG16	Q99234	619 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	GID7	P25569	745 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	BUD14	P27637	709 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	MSS51	P32335	436 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	CYM1	P32898	989 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	PHO89	P38361	574 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	TRM5	P38793	499 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	LYS9	P38999	446 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	DSE1	P40077	573 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TRS33	YOR115C	PEP8	P40335	379 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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