RNA–Protein interactions for RNA: YOL054W

PSH1, Transcript of E3 ubiquitin ligase targeting centromere-binding protein Cse4p, yeast

Gene PSH1, Length 1,221 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSH1	YOL054W	STE14	P32584	239 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.76	□□□□□ -1.49	not detected
PSH1	YOL054W	COT1	P32798	439 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	DUG2	P38149	878 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	MRX3	P38172	270 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	SAW1	P39735	261 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	JEM1	P40358	645 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	CPR7	P47103	393 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	ASM4	Q05166	528 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	YDL121C	Q07541	149 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	CRD1	Q07560	283 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	GIS3	Q12418	502 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	BI3	Q9ZZW7	517 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	RAD10	P06838	210 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	CDC42	P19073	191 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	EXO70	P19658	623 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	EMC1	P25574	760 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	MGT1	P26188	188 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	DGR2	P32330	852 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	TGL1	P34163	548 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	MSR1	P38714	643 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	YHL041W	P38730	149 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	SHC1	P39000	512 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	IES5	P40060	125 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	ARG2	P40360	574 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	EXG2	P52911	562 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	MIG2	P53035	382 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	BET4	Q00618	327 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	PRM6	Q04705	352 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	SGO1	Q08490	590 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	YDR018C	Q12185	396 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	GPM3	Q12326	303 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	YLR415C	O13578	112 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	ATP12	P22135	325 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	SPS22	P25380	463 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	RAD51	P25454	400 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	TMT1	P32643	299 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	SEG2	P34250	1132 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	YBR259W	P38338	688 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	ERC1	P38767	581 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	SMF2	P38778	549 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	MEF2	P39677	819 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	TMN3	P40071	706 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	FTR1	P40088	404 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	TMA108	P40462	946 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	CTR1	P49573	406 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	SHE10	P53075	577 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	NCS6	P53088	359 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	VPS62	P53285	467 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	COS6	P53344	381 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	MRPL22	P53881	309 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	SLT2	Q00772	484 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	DUS4	Q06063	367 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	SPH1	Q06160	661 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	YLR053C	Q12026	108 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	GPR1	Q12361	961 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	NPC2	Q12408	173 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	SPE4	Q12455	300 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	PHO3	P24031	467 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	HXT4	P32467	576 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	LRG1	P35688	1017 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	SDS22	P36047	338 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	KTR4	P38131	464 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	MSS4	P38994	779 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	CHA4	P43634	648 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	ASK10	P48361	1146 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	USE1	P53146	245 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	REC102	Q02721	264 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	GCN5	Q03330	439 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	YAP6	Q03935	383 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	YKU80	Q04437	629 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	THI7	Q05998	598 aa		5.73	□□□□□ -1.49

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