RNA–Protein interactions for RNA: YOL022C

TSR4, Cytoplasmic protein required for correct processing of 20S pre-rRNA, yeast

Gene TSR4, Length 1,227 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TSR4	YOL022C	SGF29	P25554	259 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	VPS41	P38959	992 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	AAD10	P47182	288 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	INN1	P53901	409 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	TIM10	P87108	93 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	RAD30	Q04049	632 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	SRL1	Q08673	210 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	YOR111W	Q99210	232 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	FOB1	O13329	566 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	SRB5	P32585	307 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	YBR225W	P38321	900 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	NPR2	P39923	615 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	PHM8	P40025	321 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	DJP1	P40564	432 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	MUB1	Q03162	620 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	TAH18	Q12181	623 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.49	□□□□□ -1.85	not detected
TSR4	YOL022C	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	YOR019W	Q99248	730 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	PCT1	P13259	424 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	YCK1	P23291	538 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	YSP3	P25036	478 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	MSS51	P32335	436 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	TFC3	P34111	1160 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	OCT1	P35999	772 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	SLZ1	P40167	298 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	YIR016W	P40572	265 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	IME4	P41833	600 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	IRC6	P43615	237 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	UBX6	P47049	396 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	SGM1	P47166	707 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	MSY1	P48527	492 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	YPT11	P48559	417 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	YDR109C	Q04585	715 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	MFB1	Q04922	465 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	SNA4	Q07549	140 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	MLH2	Q07980	695 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	BUD7	Q08754	746 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	BAG7	Q12128	409 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	NMD4	Q12129	218 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	HUA2	Q12134	243 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	UBX3	Q12229	455 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	YFL068W	P0CX99	160 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	KAR3	P17119	729 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	PRE8	P23639	250 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	YCR043C	P25361	127 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	NFU1	P32860	256 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	YBL029W	P38201	376 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	SWP82	P43554	623 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	RMD8	P43620	662 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	DSD1	P53095	428 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	VPS75	P53853	264 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	MRPL19	P53875	158 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	NGL3	Q03210	505 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	TAF11	Q04226	346 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	PDR8	Q06149	701 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	PIG1	Q06216	648 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	CRN1	Q06440	651 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	SWA2	Q06677	668 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
TSR4	YOL022C	GCN4	P03069	281 aa		3.46	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	SCO2	P38072	301 aa		3.46	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	RTS1	P38903	757 aa		3.46	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	FLC2	P39719	783 aa		3.46	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	MRX6	P48564	524 aa		3.46	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	YNL144C	P53907	740 aa		3.46	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	SKG3	Q06315	1026 aa		3.46	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	DSE3	Q08729	430 aa		3.46	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	MAL33	P38157	468 aa		3.45	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	VTC2	P43585	828 aa		3.45	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	3.45	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	BOP3	P53958	396 aa		3.45	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	INA17	Q02888	182 aa		3.45	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	FCP1	Q03254	732 aa		3.45	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	SPC19	Q03954	165 aa		3.45	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	CAC2	Q04199	468 aa		3.45	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	ARP9	Q05123	467 aa		3.45	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	3.45	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	GSH2	Q08220	491 aa		3.45	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	MCH4	Q08268	501 aa		3.45	□□□□□ -1.86

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