RNA–Protein interactions for RNA: YNL296W

YNL296W, Transcript of Dubious open reading frame unlikely to encode a functional protein, yeast

Gene YNL296W, Length 315 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL296W	YNL296W	CLC1	P17891	233 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	EMC1	P25574	760 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	UTR2	P32623	467 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	PHO11	P35842	467 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	BIT2	P38346	545 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	SOH1	P38633	127 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	PHO12	P38693	467 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	ERP2	P39704	215 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	MAD1	P40957	749 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	TRM9	P49957	279 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	VPS9	P54787	451 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	RSC4	Q02206	625 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	MRX10	Q05648	414 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	YDL218W	Q07629	317 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	AFT2	Q08957	416 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	DCC1	P25559	380 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	MRC1	P25588	1096 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	MCM2	P29469	868 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	MOH1	P38191	138 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	FTH1	P38310	465 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	YHR210C	P38893	341 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	YER130C	P39959	443 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	SER3	P40054	469 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	YJL107C	P42947	387 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	TY4A-J	P47023	414 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	CDC55	Q00362	526 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	ERV41	Q04651	352 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	MDM30	Q05930	598 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	TPO1	Q07824	586 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	BUD7	Q08754	746 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	PFA4	Q12006	378 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	MCD1	Q12158	566 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	OCA6	Q12454	224 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	LAG2	Q92325	660 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	FRT1	Q99332	602 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	SEM1	O94742	89 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	SPS1	P08458	490 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	TUP1	P16649	713 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
YNL296W	YNL296W	DBP8	P38719	431 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	PCL5	P38794	229 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	DSS1	P39112	969 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	GID8	P40208	455 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	RGD2	P43556	714 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	YFR020W	P43600	232 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	RRT5	P43607	289 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	RPC17	P47076	161 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	CDC14	Q00684	551 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	YPR078C	Q06813	372 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	PMS1	P14242	873 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	CDC26	P14724	124 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	VAN1	P23642	535 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	GRR1	P24814	1151 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	MKK1	P32490	508 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	AEP1	P32493	518 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
YNL296W	YNL296W	LST4	P34239	828 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	RPC25	P35718	212 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	SEA4	P38164	1038 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	YHR182W	P38870	785 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	AIM18	P38884	321 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	YEL073C	P39974	107 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	TMN3	P40071	706 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	ELO3	P40319	345 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	YPT11	P48559	417 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	COG1	P53079	417 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	YGR127W	P53275	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	HST1	P53685	503 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	ZRG17	P53735	605 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	FDC1	Q03034	503 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	RCO1	Q04779	684 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	REH1	Q06709	432 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	AAD15	Q08361	143 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	IZH4	Q99393	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	NAM9	P27929	486 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	MSP1	P28737	362 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YNL296W	YNL296W	GIC1	P38785	314 aa		4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 86.7 ms