RNA–Protein interactions for RNA: YMR115W

MGR3, Transcript of Subunit of the mitochondrial (mt) i-AAA protease supercomplex, yeast

Gene MGR3, Length 1,506 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MGR3	YMR115W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	SWA2	Q06677	668 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	SWT1	Q12104	458 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	PAH1	P32567	862 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	LEU5	P38702	357 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	RIC1	P40395	1056 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	YGL260W	P53056	76 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	COG1	P53079	417 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	ASI1	P54074	624 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	SNO4	Q04902	237 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	FMP42	Q04991	504 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	VAM6	Q07468	1049 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	HSP32	Q08992	237 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	CBP1	P07252	654 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	AAC3	P18238	307 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	STE50	P25344	346 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	NUP120	P35729	1037 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	YMR254C	Q04838	102 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	YLR302C	O13544	120 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	IMP2'	P32351	346 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	MED1	Q12321	566 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	PHO2	P07269	559 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	CHO1	P08456	276 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	TY2A-C	P25383	438 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	PPZ1	P26570	692 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	CBF2	P32504	956 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	JNM1	P36224	373 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	EFM2	P38347	419 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	LYS14	P40971	790 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	PFA5	Q03289	374 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	RTP1	Q12751	981 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MGR3	YMR115W	REG1	Q00816	1014 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MGR3	YMR115W	PET111	P08468	800 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MGR3	YMR115W	CDC16	P09798	840 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MGR3	YMR115W	CDC23	P16522	626 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MGR3	YMR115W	SPO16	P17122	198 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MGR3	YMR115W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
MGR3	YMR115W	BSC5	P53755	489 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MGR3	YMR115W	YNL181W	P53878	407 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MGR3	YMR115W	NBP2	Q12163	236 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MGR3	YMR115W	SKM1	Q12469	655 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MGR3	YMR115W	HNM1	P19807	563 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MGR3	YMR115W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
MGR3	YMR115W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
MGR3	YMR115W	BZZ1	P38822	633 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MGR3	YMR115W	YJR061W	P40355	935 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MGR3	YMR115W	ESL1	P40456	1118 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MGR3	YMR115W	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.51	□□□□□ -1.69	not detected
MGR3	YMR115W	CRN1	Q06440	651 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MGR3	YMR115W	MCP2	Q06567	569 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MGR3	YMR115W	TMA16	Q08687	178 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MGR3	YMR115W	TAH18	Q12181	623 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MGR3	YMR115W	LHS1	P36016	881 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MGR3	YMR115W	MRX1	P40050	688 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MGR3	YMR115W	ASE1	P50275	885 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MGR3	YMR115W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
MGR3	YMR115W	SEM1	O94742	89 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MGR3	YMR115W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
MGR3	YMR115W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
MGR3	YMR115W	MGR1	P25573	417 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MGR3	YMR115W	MRP20	P32387	263 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MGR3	YMR115W	SRB7	P47822	140 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MGR3	YMR115W	SDH5	Q08230	162 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MGR3	YMR115W	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MGR3	YMR115W	MRP7	P12687	371 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MGR3	YMR115W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
MGR3	YMR115W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
MGR3	YMR115W	YPK3	P38070	525 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MGR3	YMR115W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
MGR3	YMR115W	PSD1	P39006	500 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MGR3	YMR115W	CTK2	P46962	323 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MGR3	YMR115W	YNL234W	P53857	426 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MGR3	YMR115W	ARP10	Q04549	284 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MGR3	YMR115W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
MGR3	YMR115W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
MGR3	YMR115W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
MGR3	YMR115W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69

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