RNA–Protein interactions for RNA: YMR025W

CSI1, Transcript of Subunit of the Cop9 signalosome, yeast

Gene CSI1, Length 888 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSI1	YMR025W	RGI2	P40188	164 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CSI1	YMR025W	SHE10	P53075	577 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CSI1	YMR025W	BOR1	P53838	576 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CSI1	YMR025W	NUP100	Q02629	959 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CSI1	YMR025W	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
CSI1	YMR025W	VAM6	Q07468	1049 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CSI1	YMR025W	MPD2	Q99316	277 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CSI1	YMR025W	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
CSI1	YMR025W	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
CSI1	YMR025W	ECM10	P39987	644 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSI1	YMR025W	YIL060W	P40519	144 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSI1	YMR025W	SWP82	P43554	623 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSI1	YMR025W	ADD37	Q03233	198 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSI1	YMR025W	RSM28	Q03430	361 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CSI1	YMR025W	HIM1	Q06674	414 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CSI1	YMR025W	YLL056C	Q12177	298 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CSI1	YMR025W	SPO16	P17122	198 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CSI1	YMR025W	SWH1	P35845	1188 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CSI1	YMR025W	MRPL4	P36517	319 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CSI1	YMR025W	PHO90	P39535	881 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CSI1	YMR025W	YER130C	P39959	443 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CSI1	YMR025W	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
CSI1	YMR025W	SPG5	P42933	373 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CSI1	YMR025W	YFR020W	P43600	232 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CSI1	YMR025W	PKP2	P53170	491 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CSI1	YMR025W	TRS130	Q03660	1102 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CSI1	YMR025W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
CSI1	YMR025W	YEL068C	P39977	110 aa		3.85	□□□□□ -1.79
CSI1	YMR025W	YDL186W	P48568	277 aa		3.85	□□□□□ -1.79
CSI1	YMR025W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
CSI1	YMR025W	GAC1	P28006	793 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CSI1	YMR025W	NUP120	P35729	1037 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CSI1	YMR025W	SPC34	P36131	295 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CSI1	YMR025W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
CSI1	YMR025W	YPI1	P43587	155 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CSI1	YMR025W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
CSI1	YMR025W	CLB4	P24871	460 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CSI1	YMR025W	LDB16	P25587	256 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CSI1	YMR025W	AGA1	P32323	725 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CSI1	YMR025W	PHD1	P36093	366 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CSI1	YMR025W	PUG1	P40100	303 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CSI1	YMR025W	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
CSI1	YMR025W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
CSI1	YMR025W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
CSI1	YMR025W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
CSI1	YMR025W	ATS1	P31386	333 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CSI1	YMR025W	MIA40	P36046	403 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CSI1	YMR025W	YKL133C	P36066	463 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CSI1	YMR025W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
CSI1	YMR025W	YJL213W	P40896	331 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CSI1	YMR025W	IKS1	P47042	667 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CSI1	YMR025W	FMP45	Q07651	309 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CSI1	YMR025W	MSS18	P08593	268 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CSI1	YMR025W	ACH1	P32316	526 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CSI1	YMR025W	PCA1	P38360	1216 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CSI1	YMR025W	NNF2	P53253	936 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CSI1	YMR025W	YEH2	Q07950	538 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CSI1	YMR025W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
CSI1	YMR025W	ESL2	P36168	1195 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CSI1	YMR025W	ARP1	P38696	384 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CSI1	YMR025W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
CSI1	YMR025W	HIS6	P40545	261 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CSI1	YMR025W	SOL4	P53315	255 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CSI1	YMR025W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
CSI1	YMR025W	MSS11	Q03825	758 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CSI1	YMR025W	RBA50	Q04418	439 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CSI1	YMR025W	YOL159C	Q08300	171 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CSI1	YMR025W	RDR1	Q08904	546 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CSI1	YMR025W	SRB5	P32585	307 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CSI1	YMR025W	CTF18	P49956	741 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CSI1	YMR025W	ASE1	P50275	885 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CSI1	YMR025W	RPM2	Q02773	1202 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CSI1	YMR025W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
CSI1	YMR025W	ATG26	Q06321	1198 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CSI1	YMR025W	YOL057W	Q08225	711 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CSI1	YMR025W	BSC6	Q08280	497 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CSI1	YMR025W	TMA16	Q08687	178 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CSI1	YMR025W	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CSI1	YMR025W	AGP2	P38090	596 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CSI1	YMR025W	RPH1	P39956	796 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CSI1	YMR025W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CSI1	YMR025W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CSI1	YMR025W	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CSI1	YMR025W	YJL132W	P47014	750 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CSI1	YMR025W	COS10	P52924	374 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CSI1	YMR025W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CSI1	YMR025W	MET14	Q02196	202 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CSI1	YMR025W	MLC2	Q06580	163 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CSI1	YMR025W	SET6	Q12529	373 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CSI1	YMR025W	TFC3	P34111	1160 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CSI1	YMR025W	AXL1	P40851	1208 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CSI1	YMR025W	RTT101	P47050	842 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CSI1	YMR025W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
CSI1	YMR025W	COX17	Q12287	69 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CSI1	YMR025W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
CSI1	YMR025W	GAL1	P04385	528 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CSI1	YMR025W	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CSI1	YMR025W	TY2A-F	P0CX61	438 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CSI1	YMR025W	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CSI1	YMR025W	TY2A-C	P25383	438 aa		3.75	□□□□□ -1.81

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