RNA–Protein interactions for RNA: YLR369W

SSQ1, Transcript of Mitochondrial hsp70-type molecular chaperone, yeastyeast

Gene SSQ1, Length 1,974 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSQ1YLR369W YPL278CQ08990 100 aa2.33□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W SUL2Q12325 893 aa2.33□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W VAS1P07806 1104 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W ABF1P14164 731 aa2.32□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W BMH2P34730 273 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W MNN4P36044 1178 aa2.32□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W SET3P36124 751 aa2.32□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W AGP2P38090 596 aa2.32□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W PIH1P38768 344 aa2.32□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W STT3P39007 718 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W HEM14P40012 539 aa2.32□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W GPP1P41277 250 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W EPL1P43572 832 aa2.32□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W RET2P43621 546 aa2.32□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W VEL1P53058 206 aa2.32□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W WAR1Q03631 944 aa2.32□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W PRM6Q04705 352 aa2.32□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W YOR387CQ08910 206 aa2.32□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W GPM2Q12008 311 aa2.32□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W CHS5Q12114 671 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W USV1Q12132 391 aa2.32□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W TMA17Q12513 150 aa2.32□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W ECM3Q99252 613 aa2.32□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W ERG20P08524 352 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W YEL076C-AP0CX16 216 aa2.32□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W YLR464WP0CX17 216 aa2.32□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W ASP3-2P0CX77 362 aa2.32□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W ASP3-3P0CX78 362 aa2.32□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W ASP3-4P0CX79 362 aa2.32□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W ASP3-1P0CZ17 362 aa2.32□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W THR4P16120 514 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W TKL2P33315 681 aa2.32□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W GMH1P36125 273 aa2.32□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W YBR225WP38321 900 aa2.32□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W ERV46P39727 415 aa2.32□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W YEL076CP39971 216 aa2.32□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W TIF34P40217 347 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W LTP1P40347 161 aa2.32□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W IML2P47031 731 aa2.32□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W ASN1P49089 572 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W SHE10P53075 577 aa2.32□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W TOF2Q02208 771 aa2.32□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W YPL014WQ02606 381 aa2.32□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W YLR456WQ06199 204 aa2.32□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W YCG1Q06680 1035 aa2.32□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W YTM1Q12024 460 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W POM34Q12445 299 aa2.32□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W SMC6Q12749 1114 aa2.32□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W ADE3P07245 946 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W RPL43AP0CX25 92 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W RPL43BP0CX26 92 aa2.31□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W RPL1AP0CX43 217 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W RPL1BP0CX44 217 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W PET127P32606 800 aa2.31□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W YSC83P32792 385 aa2.31□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W CTP1P38152 299 aa2.31□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W ATG12P38316 186 aa2.31□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W SIP3P38717 1229 aa2.31□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W DUN1P39009 513 aa2.31□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W OAF1P39720 1047 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W YJR061WP40355 935 aa2.31□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W GZF3P42944 551 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W SCD6P45978 349 aaKnown RBP RIP-Chip data2.31□□□□□ -2.04 RIP-Chip
SSQ1YLR369W NUP84P52891 726 aa2.31□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W COX18P53239 316 aa2.31□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W YGR151CP53287 111 aa2.31□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W COQ6P53318 479 aa2.31□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W NOP13P53883 403 aaKnown RBP RIP-Chip data2.31□□□□□ -2.04not detected
SSQ1YLR369W GPD1Q00055 391 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W ECM22Q05958 814 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W YLH47Q06493 454 aa2.31□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W RPC53P25441 422 aa2.3□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W FEN2P25621 512 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W FHL1P39521 936 aa2.3□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W AVT2P39981 480 aa2.3□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W YNL195CP40168 261 aa2.3□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W BIT61P47041 543 aa2.3□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W YJR120WP47157 116 aa2.3□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W CUE3P53137 624 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W YSH1Q06224 779 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W TRE2Q08693 809 aa2.3□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W TAF10Q12030 206 aa2.3□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W RKM5Q12367 367 aa2.3□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W RAD3P06839 778 aa2.3□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W CHS1P08004 1131 aa2.3□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W TPM1P17536 199 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W NTH1P32356 751 aa2.3□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W MSS1P32559 526 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W DSS4P32601 143 aa2.3□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W PTI1P39927 425 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W ASG1P40467 964 aa2.3□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W MNN11P46985 422 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W MPS3P47069 682 aa2.3□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W NPA3P47122 385 aa2.3□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W FLC3P53121 802 aa2.3□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W TOF1P53840 1238 aa2.3□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W CBK1P53894 756 aa2.3□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W ECM9Q02202 377 aa2.3□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W HOF1Q05080 669 aa2.3□□□□□ -2.04
SSQ1YLR369W YDL086WQ07505 273 aa2.3□□□□□ -2.04
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