RNA–Protein interactions for RNA: YLR356W

ATG33, Transcript of Mitochondrial mitophagy-specific protein, yeast

Gene ATG33, Length 594 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG33	YLR356W	SIW14	P53965	281 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG33	YLR356W	CDC14	Q00684	551 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG33	YLR356W	NUP100	Q02629	959 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG33	YLR356W	NGL3	Q03210	505 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG33	YLR356W	ATG16	Q03818	150 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG33	YLR356W	SIZ1	Q04195	904 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG33	YLR356W	YDR278C	Q05612	105 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG33	YLR356W	CDA1	Q06702	301 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG33	YLR356W	FMP45	Q07651	309 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG33	YLR356W	YLR001C	Q07895	862 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG33	YLR356W	AAD15	Q08361	143 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG33	YLR356W	DIN7	Q12086	430 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG33	YLR356W	MDM35	O60200	86 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG33	YLR356W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATG33	YLR356W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATG33	YLR356W	IMG1	P25626	169 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG33	YLR356W	SEC65	P29478	273 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG33	YLR356W	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATG33	YLR356W	JNM1	P36224	373 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG33	YLR356W	LDB7	P38210	180 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG33	YLR356W	FLC2	P39719	783 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG33	YLR356W	ARG2	P40360	574 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG33	YLR356W	YJL107C	P42947	387 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG33	YLR356W	YGR021W	P53212	290 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG33	YLR356W	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATG33	YLR356W	YNL092W	P53934	400 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG33	YLR356W	ECM9	Q02202	377 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG33	YLR356W	CCE1	Q03702	353 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG33	YLR356W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATG33	YLR356W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATG33	YLR356W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATG33	YLR356W	ESC2	Q06340	456 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG33	YLR356W	NRT1	Q08485	598 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG33	YLR356W	ATE1	P16639	503 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG33	YLR356W	URA4	P20051	364 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG33	YLR356W	SFL1	P20134	766 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG33	YLR356W	VAN1	P23642	535 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG33	YLR356W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ATG33	YLR356W	DOM34	P33309	386 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG33	YLR356W	CTF13	P35203	478 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG33	YLR356W	EMC3	P36039	253 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG33	YLR356W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ATG33	YLR356W	SAW1	P39735	261 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG33	YLR356W	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ATG33	YLR356W	MGS1	P40151	587 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG33	YLR356W	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ATG33	YLR356W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ATG33	YLR356W	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ATG33	YLR356W	RSC4	Q02206	625 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG33	YLR356W	RMD5	Q12508	421 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG33	YLR356W	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ATG33	YLR356W	CDC9	P04819	755 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG33	YLR356W	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ATG33	YLR356W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ATG33	YLR356W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ATG33	YLR356W	PHO13	P19881	312 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG33	YLR356W	MSH1	P25846	959 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG33	YLR356W	DBF4	P32325	704 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG33	YLR356W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ATG33	YLR356W	MRPL15	P36523	253 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG33	YLR356W	FTH1	P38310	465 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG33	YLR356W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ATG33	YLR356W	YHR210C	P38893	341 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG33	YLR356W	GTS1	P40956	396 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG33	YLR356W	IME4	P41833	600 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG33	YLR356W	YFR020W	P43600	232 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG33	YLR356W	NNF2	P53253	936 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG33	YLR356W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ATG33	YLR356W	RCO1	Q04779	684 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG33	YLR356W	YLR287C	Q05881	355 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG33	YLR356W	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.77	□□□□□ -1.65	not detected
ATG33	YLR356W	YLL056C	Q12177	298 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG33	YLR356W	YOL107W	Q12239	342 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG33	YLR356W	SWI5	P08153	709 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG33	YLR356W	ERG11	P10614	530 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG33	YLR356W	HOP1	P20050	605 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG33	YLR356W	SLY1	P22213	666 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG33	YLR356W	AMS1	P22855	1083 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG33	YLR356W	GDA1	P32621	518 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG33	YLR356W	UTR2	P32623	467 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG33	YLR356W	BLI1	P35727	113 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG33	YLR356W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATG33	YLR356W	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATG33	YLR356W	HIS2	P38635	335 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG33	YLR356W	YHR182W	P38870	785 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG33	YLR356W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATG33	YLR356W	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATG33	YLR356W	PLB1	P39105	664 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG33	YLR356W	RGI2	P40188	164 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG33	YLR356W	IRR1	P40541	1150 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG33	YLR356W	ELP2	P42935	788 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG33	YLR356W	KXD1	P53158	218 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG33	YLR356W	YPR003C	P53394	754 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG33	YLR356W	AGE1	Q04412	482 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG33	YLR356W	RSF1	Q05043	376 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG33	YLR356W	BLS1	Q06071	122 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG33	YLR356W	NUT2	Q06213	157 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG33	YLR356W	REH1	Q06709	432 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG33	YLR356W	HOM3	P10869	527 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG33	YLR356W	SPO12	P17123	173 aa		4.75	□□□□□ -1.65

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