RNA–Protein interactions for RNA: YLR224W

YLR224W, Transcript of F-box protein and component of SCF ubiquitin ligase complexes, yeast

Gene YLR224W, Length 1,110 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR224W	YLR224W	SLZ1	P40167	298 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	YIL152W	P40455	235 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	PKP1	P40530	394 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	MAF1	P41910	395 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	YFR020W	P43600	232 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	ASI1	P54074	624 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	MUB1	Q03162	620 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	SNO4	Q04902	237 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	ECI1	Q05871	280 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	SKG3	Q06315	1026 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	MCP2	Q06567	569 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	OPY2	Q06810	360 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	POS5	Q06892	414 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	MLH2	Q07980	695 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	HSP32	Q08992	237 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	YOL087C	Q99247	1116 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YLR224W	YLR224W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	SSH4	P32343	579 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	GCS1	P35197	352 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	ALY1	P36117	915 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	MNN2	P38069	597 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	PCL6	P40038	420 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	SMC3	P47037	1230 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	AAD10	P47182	288 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	CBK1	P53894	756 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	YMR018W	Q04364	514 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	SNA4	Q07549	140 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	UIP3	P39547	235 aa		3.07	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	FMP10	P40098	244 aa		3.07	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	VRG4	P40107	337 aa		3.07	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	YJR061W	P40355	935 aa		3.07	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	NNF2	P53253	936 aa		3.07	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	YTP1	P53584	459 aa		3.07	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	YNL181W	P53878	407 aa		3.07	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	INA17	Q02888	182 aa		3.07	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	IZH1	Q03419	316 aa		3.07	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	NUP53	Q03790	475 aa		3.07	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	ARP10	Q04549	284 aa		3.07	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	ARP9	Q05123	467 aa		3.07	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	SRL1	Q08673	210 aa		3.07	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	NDD1	Q08887	554 aa		3.07	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	YLR112W	Q12130	139 aa		3.07	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	ATG9	Q12142	997 aa		3.07	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	YCR043C	P25361	127 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	YKL050C	P35736	922 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	STV1	P37296	890 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	SGF73	P53165	657 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	BSC5	P53755	489 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	INN1	P53901	409 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	YLR281C	Q05863	155 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	PSR1	Q07800	427 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	BUD7	Q08754	746 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	INP53	Q12271	1107 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	YFL068W	P0CX99	160 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	RPB8	P20436	146 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	SPE2	P21182	396 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	MIA40	P36046	403 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	LEU5	P38702	357 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	SIP4	P46954	829 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.05	□□□□□ -1.92	not detected
YLR224W	YLR224W	BET4	Q00618	327 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	APL4	Q12028	832 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	SKM1	Q12469	655 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	EDE1	P34216	1381 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	CBP1	P07252	654 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	PRE8	P23639	250 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	GAC1	P28006	793 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	RKM3	P38222	552 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	YIL169C	P40442	995 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	IAH1	P41734	238 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	MEP3	P53390	489 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	YNL234W	P53857	426 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	ESBP6	P53918	673 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	MAK10	Q02197	733 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	ENT4	Q07872	247 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	SWR1	Q05471	1514 aa		3.03	□□□□□ -1.92

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 57.6 ms