RNA–Protein interactions for RNA: YLL055W

YCT1, Transcript of High-affinity cysteine-specific transporter, yeast

Gene YCT1, Length 1,596 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YCT1	YLL055W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	MCP2	Q06567	569 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	HSP32	Q08992	237 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	YBR085C-A	O43137	85 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	CBP1	P07252	654 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	YFL068W	P0CX99	160 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	CLB2	P24869	491 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	YCR043C	P25361	127 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	DPB3	P27344	201 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	LEU5	P38702	357 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	YTP1	P53584	459 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	MUB1	Q03162	620 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	ARP10	Q04549	284 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	ARP9	Q05123	467 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	NBP2	Q12163	236 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	YOL087C	Q99247	1116 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	PKP1	P40530	394 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	SCS3	P53012	380 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	SGF73	P53165	657 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	TDA9	Q04545	1251 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	CBF2	P32504	956 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	ALY1	P36117	915 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	MET30	P39014	640 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	SLZ1	P40167	298 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	YIL169C	P40442	995 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	SMC3	P47037	1230 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	NNF2	P53253	936 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	YNL234W	P53857	426 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	YNL181W	P53878	407 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	CBK1	P53894	756 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	ESBP6	P53918	673 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	SSP2	Q08646	371 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	RPB8	P20436	146 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	RER1	P25560	188 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	STV1	P37296	890 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	YLR281C	Q05863	155 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	SKG3	Q06315	1026 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	ATG9	Q12142	997 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	YUR1	P26725	428 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	FMP10	P40098	244 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	YJR061W	P40355	935 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	HXT9	P40885	567 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	INN1	P53901	409 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	BET4	Q00618	327 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	INA17	Q02888	182 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	YOL159C	Q08300	171 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	INP53	Q12271	1107 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	EDE1	P34216	1381 aa		3.28	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	YKL050C	P35736	922 aa		3.28	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	MIA40	P36046	403 aa		3.28	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	YPK3	P38070	525 aa		3.28	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	UIP3	P39547	235 aa		3.28	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	MEP2	P41948	499 aa		3.28	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	AAD10	P47182	288 aa		3.28	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	MAK10	Q02197	733 aa		3.28	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	YMR254C	Q04838	102 aa		3.28	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	APL4	Q12028	832 aa		3.28	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	3.27	□□□□□ -1.89
YCT1	YLL055W	SPE2	P21182	396 aa		3.27	□□□□□ -1.89
YCT1	YLL055W	GAC1	P28006	793 aa		3.27	□□□□□ -1.89
YCT1	YLL055W	PDR3	P33200	976 aa		3.27	□□□□□ -1.89
YCT1	YLL055W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	3.27	□□□□□ -1.89
YCT1	YLL055W	RKM3	P38222	552 aa		3.27	□□□□□ -1.89
YCT1	YLL055W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	3.27	□□□□□ -1.89
YCT1	YLL055W	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	3.27	□□□□□ -1.89
YCT1	YLL055W	BUR6	P40096	142 aa		3.27	□□□□□ -1.89
YCT1	YLL055W	STB2	P46679	850 aa		3.27	□□□□□ -1.89
YCT1	YLL055W	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	3.27	□□□□□ -1.89
YCT1	YLL055W	EKI1	Q03764	534 aa		3.27	□□□□□ -1.89
YCT1	YLL055W	YMR018W	Q04364	514 aa		3.27	□□□□□ -1.89
YCT1	YLL055W	FMP42	Q04991	504 aa		3.27	□□□□□ -1.89
YCT1	YLL055W	GRS2	Q06817	618 aa		3.27	□□□□□ -1.89
YCT1	YLL055W	YDL218W	Q07629	317 aa		3.27	□□□□□ -1.89
YCT1	YLL055W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	3.27	□□□□□ -1.89
YCT1	YLL055W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	3.26	□□□□□ -1.89
YCT1	YLL055W	MGR1	P25573	417 aa		3.26	□□□□□ -1.89
YCT1	YLL055W	SSH4	P32343	579 aa		3.26	□□□□□ -1.89
YCT1	YLL055W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	3.26	□□□□□ -1.89
YCT1	YLL055W	YIL060W	P40519	144 aa		3.26	□□□□□ -1.89
YCT1	YLL055W	IAH1	P41734	238 aa		3.26	□□□□□ -1.89
YCT1	YLL055W	SAD1	P43589	448 aa		3.26	□□□□□ -1.89
YCT1	YLL055W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	3.26	□□□□□ -1.89
YCT1	YLL055W	SIP4	P46954	829 aa		3.26	□□□□□ -1.89
YCT1	YLL055W	BSC5	P53755	489 aa		3.26	□□□□□ -1.89
YCT1	YLL055W	OPY2	Q06810	360 aa		3.26	□□□□□ -1.89

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 22.5 ms