RNA–Protein interactions for RNA: YKR088C

TVP38, Transcript of Integral membrane protein, yeast

Gene TVP38, Length 1,014 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TVP38	YKR088C	ECM4	P36156	370 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	UBP13	P38187	747 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	CST26	P38226	397 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	COG6	P53959	839 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	UBX4	P54730	416 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	ARO80	Q04052	950 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	VHS3	Q08438	674 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	SLX4	Q12098	748 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	RRD2	Q12461	358 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	YAK1	P14680	807 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	EXO70	P19658	623 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	VPH2	P32341	215 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	CBF2	P32504	956 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	YKU70	P32807	602 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	LHS1	P36016	881 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	UBP11	P36026	717 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	EMC3	P36039	253 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	DUG2	P38149	878 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	YBP1	P38315	674 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	PCA1	P38360	1216 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	STN1	P38960	494 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	PHO86	P46956	311 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	FMP33	P46998	180 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	MIG2	P53035	382 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	USE1	P53146	245 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	RPM2	Q02773	1202 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	ORM2	Q06144	216 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	not detected
TVP38	YKR088C	CIT2	P08679	460 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	URA4	P20051	364 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	DAL2	P25335	343 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	MGT1	P26188	188 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	HES1	P35843	434 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	TSC10	P38342	320 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	SMF2	P38778	549 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	FIS1	P40515	155 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	IAH1	P41734	238 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	YJL107C	P42947	387 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	SAE2	P46946	345 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	HOP2	P53187	214 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	RNH70	P53331	553 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	RPN4	Q03465	531 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	ACL4	Q03771	387 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	YLR053C	Q12026	108 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	GET4	Q12125	312 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	YDR018C	Q12185	396 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	GPM3	Q12326	303 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	GRX6	Q12438	231 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	SPE4	Q12455	300 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	YOR131C	Q12486	218 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	RTP1	Q12751	981 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	BI2	P03873	423 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	RRT12	P25381	491 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	SEC6	P32844	805 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	CSG2	P35206	410 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	MSR1	P38714	643 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	MUP3	P38734	546 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	FMO1	P38866	432 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	XBP1	P40489	647 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	SHR5	P41912	237 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	STB2	P46679	850 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	TIM54	P47045	478 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	YML6	P51998	286 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	SHE10	P53075	577 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	MTL1	P53214	551 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	TAM41	P53230	385 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	YGR125W	P53273	1036 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	MPS1	P54199	764 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	PRM6	Q04705	352 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	IVY1	Q04934	453 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TVP38	YKR088C	PHM6	Q05637	104 aa		4.61	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 27.3 ms