RNA–Protein interactions for RNA: YKL111C

YKL111C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKL111C, Length 336 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL111CYKL111C MNN2P38069 597 aa2.59□□□□□ -1.99
YKL111CYKL111C ARC40P38328 384 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
YKL111CYKL111C SLZ1P40167 298 aa2.59□□□□□ -1.99
YKL111CYKL111C DPH1P40487 425 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
YKL111CYKL111C YIR016WP40572 265 aa2.59□□□□□ -1.99
YKL111CYKL111C TES1P41903 349 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
YKL111CYKL111C ZDS2P54786 942 aa2.59□□□□□ -1.99
YKL111CYKL111C IZH1Q03419 316 aa2.59□□□□□ -1.99
YKL111CYKL111C YKU80Q04437 629 aa2.59□□□□□ -1.99
YKL111CYKL111C YMR034CQ05131 434 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
YKL111CYKL111C SNA4Q07549 140 aa2.59□□□□□ -1.99
YKL111CYKL111C YLR049CQ12110 428 aa2.59□□□□□ -1.99
YKL111CYKL111C YLR302CO13544 120 aa2.58□□□□□ -2
YKL111CYKL111C PFK2P16862 959 aaKnown RBP RIP-Chip data2.58□□□□□ -2not detected
YKL111CYKL111C YUR1P26725 428 aa2.58□□□□□ -2
YKL111CYKL111C CNS1P33313 385 aa2.58□□□□□ -2
YKL111CYKL111C ALY1P36117 915 aa2.58□□□□□ -2
YKL111CYKL111C ESL2P36168 1195 aa2.58□□□□□ -2
YKL111CYKL111C SCO2P38072 301 aa2.58□□□□□ -2
YKL111CYKL111C EFM2P38347 419 aa2.58□□□□□ -2
YKL111CYKL111C UME6P39001 836 aa2.58□□□□□ -2
YKL111CYKL111C PKP1P40530 394 aa2.58□□□□□ -2
YKL111CYKL111C IML2P47031 731 aa2.58□□□□□ -2
YKL111CYKL111C VPS25P47142 202 aa2.58□□□□□ -2
YKL111CYKL111C BOP3P53958 396 aa2.58□□□□□ -2
YKL111CYKL111C SVL3Q03088 825 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
YKL111CYKL111C ADE13Q05911 482 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
YKL111CYKL111C RTT109Q07794 436 aa2.58□□□□□ -2
YKL111CYKL111C DSE3Q08729 430 aa2.58□□□□□ -2
YKL111CYKL111C APL5Q08951 932 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
YKL111CYKL111C NUS1Q12063 375 aa2.58□□□□□ -2
YKL111CYKL111C CBP1P07252 654 aa2.57□□□□□ -2
YKL111CYKL111C RAP1P11938 827 aa2.57□□□□□ -2
YKL111CYKL111C GAC1P28006 793 aa2.57□□□□□ -2
YKL111CYKL111C SNU114P36048 1008 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
YKL111CYKL111C YND1P40009 630 aa2.57□□□□□ -2
YKL111CYKL111C KAP123P40069 1113 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
YKL111CYKL111C AAD10P47182 288 aa2.57□□□□□ -2
YKL111CYKL111C MEP3P53390 489 aa2.57□□□□□ -2
YKL111CYKL111C LSC1P53598 329 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
YKL111CYKL111C IST1P53843 298 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
YKL111CYKL111C FCP1Q03254 732 aa2.57□□□□□ -2
YKL111CYKL111C NUP53Q03790 475 aa2.57□□□□□ -2
YKL111CYKL111C ARP10Q04549 284 aa2.57□□□□□ -2
YKL111CYKL111C ECI1Q05871 280 aa2.57□□□□□ -2
YKL111CYKL111C BUD7Q08754 746 aa2.57□□□□□ -2
YKL111CYKL111C YPL272CQ08984 517 aa2.57□□□□□ -2
YKL111CYKL111C YBR085C-AO43137 85 aa2.56□□□□□ -2
YKL111CYKL111C FUM1P08417 488 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
YKL111CYKL111C RPL19AP0CX82 189 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
YKL111CYKL111C RPL19BP0CX83 189 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
YKL111CYKL111C CDC23P16522 626 aa2.56□□□□□ -2
YKL111CYKL111C PGS1P25578 521 aa2.56□□□□□ -2
YKL111CYKL111C PDB1P32473 366 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
YKL111CYKL111C MIA40P36046 403 aa2.56□□□□□ -2
YKL111CYKL111C YNG2P38806 282 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
YKL111CYKL111C MET30P39014 640 aa2.56□□□□□ -2
YKL111CYKL111C PHO90P39535 881 aa2.56□□□□□ -2
YKL111CYKL111C YIL060WP40519 144 aa2.56□□□□□ -2
YKL111CYKL111C LYS4P49367 693 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
YKL111CYKL111C SGF73P53165 657 aa2.56□□□□□ -2
YKL111CYKL111C PKP2P53170 491 aa2.56□□□□□ -2
YKL111CYKL111C BET4Q00618 327 aa2.56□□□□□ -2
YKL111CYKL111C DIG1Q03063 452 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
YKL111CYKL111C EKI1Q03764 534 aa2.56□□□□□ -2
YKL111CYKL111C YMR254CQ04838 102 aa2.56□□□□□ -2
YKL111CYKL111C UTP21Q06078 939 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
YKL111CYKL111C VIP1Q06685 1146 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
YKL111CYKL111C NDD1Q08887 554 aa2.56□□□□□ -2
YKL111CYKL111C INP53Q12271 1107 aa2.56□□□□□ -2
YKL111CYKL111C PWP1P21304 576 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
YKL111CYKL111C CDC15P27636 974 aa2.55□□□□□ -2
YKL111CYKL111C RFC1P38630 861 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
YKL111CYKL111C DIA4P38705 446 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
YKL111CYKL111C UIP3P39547 235 aa2.55□□□□□ -2
YKL111CYKL111C YJR061WP40355 935 aa2.55□□□□□ -2
YKL111CYKL111C YIL169CP40442 995 aa2.55□□□□□ -2
YKL111CYKL111C MEP2P41948 499 aa2.55□□□□□ -2
YKL111CYKL111C FET5P43561 622 aa2.55□□□□□ -2
YKL111CYKL111C RPS10BP46784 105 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
YKL111CYKL111C DPB11P47027 764 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
YKL111CYKL111C STR3P53101 465 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
YKL111CYKL111C CBK1P53894 756 aa2.55□□□□□ -2
YKL111CYKL111C SMA1Q02651 245 aa2.55□□□□□ -2
YKL111CYKL111C YMR178WQ03219 274 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
YKL111CYKL111C SKG3Q06315 1026 aa2.55□□□□□ -2
YKL111CYKL111C RIX7Q07844 837 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
YKL111CYKL111C ENT4Q07872 247 aa2.55□□□□□ -2
YKL111CYKL111C EDE1P34216 1381 aa2.54□□□□□ -2
YKL111CYKL111C HXK2P04807 486 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
YKL111CYKL111C KAR3P17119 729 aa2.54□□□□□ -2
YKL111CYKL111C RER1P25560 188 aa2.54□□□□□ -2
YKL111CYKL111C MGR1P25573 417 aa2.54□□□□□ -2
YKL111CYKL111C SEC1P30619 724 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
YKL111CYKL111C MCM10P32354 571 aa2.54□□□□□ -2
YKL111CYKL111C YPK3P38070 525 aa2.54□□□□□ -2
YKL111CYKL111C UBA4P38820 440 aa2.54□□□□□ -2
YKL111CYKL111C RTS2P40962 232 aa2.54□□□□□ -2
YKL111CYKL111C ARC1P46672 376 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
YKL111CYKL111C SMC3P47037 1230 aa2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.6 ms