RNA–Protein interactions for RNA: YJR068W

RFC2, Transcript of Subunit of heteropentameric Replication factor C (RF-C), yeast

Gene RFC2, Length 1,062 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RFC2	YJR068W	SCM3	Q12334	223 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	SEM1	O94742	89 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	ARG1	P22768	420 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	DBF4	P32325	704 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	TVP23	P38962	199 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	YEL025C	P39991	1188 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	CIR1	P42940	261 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	BIT61	P47041	543 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	FHN1	P53279	174 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	DIP5	P53388	608 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	YPL150W	Q12152	901 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	AHC1	Q12433	566 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	LAA1	P39526	2014 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	SEC12	P11655	471 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	HMG2	P12684	1045 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	CLN3	P13365	580 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	SFB3	P38810	929 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	VFA1	P40080	203 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
RFC2	YJR068W	SAD1	P43589	448 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	TEL2	P53038	688 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	RCF1	Q03713	159 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	TAF11	Q04226	346 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	VPS20	Q04272	221 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	MFB1	Q04922	465 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	AIM41	Q12032	185 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	NBP2	Q12163	236 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	PNS1	Q12412	539 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	RED1	P14291	827 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	ALG1	P16661	449 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	SPO16	P17122	198 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	PRE4	P30657	266 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	OAR1	P35731	278 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	BYE1	P36106	594 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	MOH1	P38191	138 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	YJR061W	P40355	935 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	FIS1	P40515	155 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	YIR014W	P40570	242 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	NPA3	P47122	385 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	STB4	P50104	949 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	YMR206W	Q03695	313 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	ARP9	Q05123	467 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	MLH3	Q12083	715 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	TIP41	Q12199	356 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	POM34	Q12445	299 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	SMC6	Q12749	1114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFC2	YJR068W	SGF29	P25554	259 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFC2	YJR068W	MSS51	P32335	436 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFC2	YJR068W	MTH1	P35198	433 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFC2	YJR068W	PHO11	P35842	467 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFC2	YJR068W	YBR225W	P38321	900 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFC2	YJR068W	PHO12	P38693	467 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFC2	YJR068W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RFC2	YJR068W	IRC6	P43615	237 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFC2	YJR068W	ZAP1	P47043	880 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFC2	YJR068W	COG1	P53079	417 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFC2	YJR068W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RFC2	YJR068W	PGA2	P53903	129 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFC2	YJR068W	FUS2	Q05670	677 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFC2	YJR068W	COQ9	Q05779	260 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFC2	YJR068W	HIF1	Q12373	385 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFC2	YJR068W	PCD1	Q12524	340 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFC2	YJR068W	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFC2	YJR068W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RFC2	YJR068W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RFC2	YJR068W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RFC2	YJR068W	FUB1	P25659	250 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RFC2	YJR068W	CBF2	P32504	956 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RFC2	YJR068W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RFC2	YJR068W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RFC2	YJR068W	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RFC2	YJR068W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RFC2	YJR068W	MAL33	P38157	468 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RFC2	YJR068W	STB5	P38699	743 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RFC2	YJR068W	REV7	P38927	245 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RFC2	YJR068W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RFC2	YJR068W	JHD1	P40034	492 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RFC2	YJR068W	UBP7	P40453	1071 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RFC2	YJR068W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RFC2	YJR068W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RFC2	YJR068W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RFC2	YJR068W	MEH1	Q02205	184 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RFC2	YJR068W	YPL071C	Q02864	156 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RFC2	YJR068W	YLH47	Q06493	454 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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