RNA–Protein interactions for RNA: YJL033W

HCA4, Transcript of DEAD box RNA helicase, yeastyeast

Gene HCA4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HCA4YJL033W GTR1Q00582 310 aa4□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W ATG26Q06321 1198 aa4□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W YOL075CQ08234 1294 aa4□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W TGS1Q12052 315 aa4□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W PSF3Q12146 194 aa4□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W HOS1Q12214 470 aa4□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W PFK2P16862 959 aaKnown RBP RIP-Chip data4□□□□□ -1.77not detected
HCA4YJL033W TPM1P17536 199 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W PRO3P32263 286 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W MGM1P32266 881 aa4□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W PET309P32522 965 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W LOT5P34234 306 aa4□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W KES1P35844 434 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W KAP123P40069 1113 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W ATF1P40353 525 aa4□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W CSM2P40465 213 aa4□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W SYG1P40528 902 aa4□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W BTN2P53286 410 aa4□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W BUD17P53727 317 aa4□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W GIS1Q03833 894 aa4□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W MGR3Q04472 501 aa4□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W SLK19Q08581 821 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W YPL150WQ12152 901 aa4□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W NDJ1Q12366 352 aa4□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W ZPS1Q12512 249 aa4□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W YRF1-3P0CX14 1859 aa3.99□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W YRF1-7P0CX15 1859 aa3.99□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W YRF1-6P53819 1859 aa3.99□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W CDC8P00572 216 aa3.99□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W PCK1P10963 549 aa3.99□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W CDC10P25342 322 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W CNS1P33313 385 aa3.99□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W RPC25P35718 212 aa3.99□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W OSH3P38713 996 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W RIM4P38741 713 aa3.99□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W RRP8P38961 392 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W SPO22P40511 975 aa3.99□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W MAD2P40958 196 aa3.99□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W RPT4P53549 437 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W CPR8P53728 308 aa3.99□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W VAC14Q06708 880 aa3.99□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W NUR1Q12066 484 aa3.99□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W RTK1Q12100 620 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W NYV1Q12255 253 aa3.99□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W OCA6Q12454 224 aa3.99□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W TMA7Q3E764 64 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W YOR111WQ99210 232 aa3.99□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W FAR1P21268 830 aa3.99□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W YLF2P38746 405 aa3.99□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W SCS2P40075 244 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W IRC8P47046 822 aa3.99□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W TMA22P47089 198 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W LYS4P49367 693 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W YGL117WP53133 265 aa3.99□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W PEX8P53248 589 aa3.99□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W ESF2P53743 316 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W CNM67P53865 581 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W RPS15Q01855 142 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W USA1Q03714 838 aa3.99□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W YMR111CQ04461 462 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W SPN1Q06505 410 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W NOP6Q07623 225 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W ADE5,7P07244 802 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W ADE3P07245 946 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W ADH4P10127 382 aa3.98□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W PAP1P29468 568 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W DSS4P32601 143 aa3.98□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W FRD1P32614 470 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W FLO10P36170 1169 aa3.98□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W CCL1P37366 393 aa3.98□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W SPL2P38839 148 aa3.98□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W LYS14P40971 790 aa3.98□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W SEC27P41811 889 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W YNR071CP53757 342 aa3.98□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W YKR005CQ02203 525 aa3.98□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W SND1Q04007 877 aa3.98□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W SPC24Q04477 213 aa3.98□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W TFC6Q06339 672 aa3.98□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W DIN7Q12086 430 aa3.98□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W SGT2Q12118 346 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W ARG4P04076 463 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W PET122P10355 254 aa3.98□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W PHO3P24031 467 aa3.98□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W SWI4P25302 1093 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W PTK1P36002 662 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W YKT6P36015 200 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W SDS22P36047 338 aa3.98□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W HEK2P38199 381 aaKnown RBP RIP-Chip data3.98□□□□□ -1.77not detected
HCA4YJL033W SAW1P39735 261 aa3.98□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W AXL1P40851 1208 aa3.98□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W YNL034WP53963 612 aa3.98□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W YNL018CP53976 612 aa3.98□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W IRC4Q03036 179 aa3.98□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W GIR2Q03768 265 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W VAM6Q07468 1049 aa3.98□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W ULA1Q12059 462 aa3.98□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W RTP1Q12751 981 aa3.98□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W URA3P03962 267 aa3.97□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W WHI2P12611 486 aa3.97□□□□□ -1.77
HCA4YJL033W YMC1P32331 307 aa3.97□□□□□ -1.77
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