RNA–Protein interactions for RNA: YHR067W

HTD2, Transcript of Mitochondrial 3-hydroxyacyl-thioester dehydratase, yeast

Gene HTD2, Length 843 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HTD2	YHR067W	MPS1	P54199	764 aa		4.14	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	ENT4	Q07872	247 aa		4.14	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.14	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	AAD10	P47182	288 aa		4.13	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	YTP1	P53584	459 aa		4.13	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	SKG3	Q06315	1026 aa		4.13	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	POS5	Q06892	414 aa		4.13	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	GSH2	Q08220	491 aa		4.13	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	ATG9	Q12142	997 aa		4.13	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	PKP1	P40530	394 aa		4.12	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	NNF2	P53253	936 aa		4.12	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	BSC5	P53755	489 aa		4.12	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	YPL068C	Q02749	293 aa		4.12	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	IZH1	Q03419	316 aa		4.12	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	YOL159C	Q08300	171 aa		4.12	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	SKM1	Q12469	655 aa		4.12	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	CLB2	P24869	491 aa		4.11	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	INA17	Q02888	182 aa		4.11	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	RAD30	Q04049	632 aa		4.11	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	CIR2	Q08822	631 aa		4.11	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	UBX3	Q12229	455 aa		4.11	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	INP53	Q12271	1107 aa		4.11	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	YEL068C	P39977	110 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	BUR6	P40096	142 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	VRG4	P40107	337 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	IRC8	P47046	822 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	SGF73	P53165	657 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	BOP3	P53958	396 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	MCP2	Q06567	569 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	SNA4	Q07549	140 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	PSR1	Q07800	427 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	YOR111W	Q99210	232 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	ATO2	P32907	282 aa		4.09	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	LEU5	P38702	357 aa		4.09	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	YIL152W	P40455	235 aa		4.09	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	HXT9	P40885	567 aa		4.09	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	LYS14	P40971	790 aa		4.09	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	SMC3	P47037	1230 aa		4.09	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	YSA1	Q01976	231 aa		4.09	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	ARP10	Q04549	284 aa		4.09	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	MLH2	Q07980	695 aa		4.09	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	DSE3	Q08729	430 aa		4.09	□□□□□ -1.75
HTD2	YHR067W	CBP1	P07252	654 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HTD2	YHR067W	CDC16	P09798	840 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HTD2	YHR067W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
HTD2	YHR067W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
HTD2	YHR067W	PRE8	P23639	250 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HTD2	YHR067W	CHS3	P29465	1165 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HTD2	YHR067W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
HTD2	YHR067W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
HTD2	YHR067W	STV1	P37296	890 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HTD2	YHR067W	MNN2	P38069	597 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HTD2	YHR067W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
HTD2	YHR067W	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
HTD2	YHR067W	RTS1	P38903	757 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HTD2	YHR067W	UIP3	P39547	235 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HTD2	YHR067W	MAK10	Q02197	733 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HTD2	YHR067W	ARP9	Q05123	467 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HTD2	YHR067W	ECI1	Q05871	280 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HTD2	YHR067W	TCO89	Q08921	799 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HTD2	YHR067W	YDR056C	Q12025	205 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HTD2	YHR067W	EDE1	P34216	1381 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HTD2	YHR067W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
HTD2	YHR067W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
HTD2	YHR067W	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HTD2	YHR067W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HTD2	YHR067W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HTD2	YHR067W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
HTD2	YHR067W	YKL050C	P35736	922 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HTD2	YHR067W	MAL33	P38157	468 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HTD2	YHR067W	PCL6	P40038	420 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HTD2	YHR067W	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
HTD2	YHR067W	ESBP6	P53918	673 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HTD2	YHR067W	YKU80	Q04437	629 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HTD2	YHR067W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
HTD2	YHR067W	APL4	Q12028	832 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HTD2	YHR067W	TOP1	P04786	769 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HTD2	YHR067W	RPB8	P20436	146 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HTD2	YHR067W	SPE2	P21182	396 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HTD2	YHR067W	VMA16	P23968	213 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HTD2	YHR067W	MIA40	P36046	403 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HTD2	YHR067W	YIL060W	P40519	144 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HTD2	YHR067W	DIA3	P52290	468 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HTD2	YHR067W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
HTD2	YHR067W	YNL234W	P53857	426 aa		4.06	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.4 ms