RNA–Protein interactions for RNA: YHL009W-A

YHL009W-A, Transcript of Retrotransposon TYA Gag gene co-transcribed with TYB Pol, yeastyeast

Gene YHL009W-A, Length 1,242 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL009W-AYHL009W-A MSS18P08593 268 aa2.65□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A SST2P11972 698 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A ERG1P32476 496 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A EIS1Q05050 843 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A YDL218WQ07629 317 aa2.65□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A PET122P10355 254 aa2.64□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A BIK1P11709 440 aa2.64□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A SAC1P32368 623 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A RRP3P38712 501 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A HIS6P40545 261 aa2.64□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A ATG21Q02887 496 aa2.64□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A MTG1Q03151 367 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A YOL159CQ08300 171 aa2.64□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A RPL15AP05748 204 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A PIF1P07271 859 aa2.63□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A SRP54P20424 541 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A HXT1P32465 570 aa2.63□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A PTH1P38876 190 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A RGI2P40188 164 aa2.63□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A GUF1P46943 645 aa2.63□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A DCP2P53550 970 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A CPR6P53691 371 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A MET14Q02196 202 aa2.63□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A PET111P08468 800 aa2.62□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A RAP1P11938 827 aa2.62□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A MCK1P21965 375 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A YEL045CP32616 141 aa2.62□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A SRO77P38163 1010 aa2.62□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A IKS1P47042 667 aa2.62□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A IMA1P53051 589 aa2.62□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A MAK10Q02197 733 aa2.62□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A ATG23Q06671 453 aa2.62□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A SWA2Q06677 668 aa2.62□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A TMA7Q3E764 64 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A ATS1P31386 333 aa2.61□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A RPH1P39956 796 aa2.61□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A PUG1P40100 303 aa2.61□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A SMK1P41808 388 aa2.61□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A YFR016CP43597 1233 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A YTP1P53584 459 aa2.61□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A NUP100Q02629 959 aa2.61□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A HCR1Q05775 265 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A YEH2Q07950 538 aa2.61□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A PCD1Q12524 340 aa2.61□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A SET6Q12529 373 aa2.61□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A KRS1P15180 591 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A NCP1P16603 691 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A LHS1P36016 881 aa2.6□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A ERR3P42222 437 aa2.6□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A COS10P52924 374 aa2.6□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A TDA7P53882 636 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A PAL1Q05518 499 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A MLC2Q06580 163 aa2.6□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A CLB2P24869 491 aa2.59□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A LRE1P25579 583 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A GCD7P32502 381 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A YKL133CP36066 463 aa2.59□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A VAM6Q07468 1049 aa2.59□□□□□ -1.99
YHL009W-AYHL009W-A MIS1P09440 975 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
YHL009W-AYHL009W-A CLB4P24871 460 aa2.58□□□□□ -2
YHL009W-AYHL009W-A AGP2P38090 596 aa2.58□□□□□ -2
YHL009W-AYHL009W-A YHL041WP38730 149 aa2.58□□□□□ -2
YHL009W-AYHL009W-A FSH1P38777 243 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
YHL009W-AYHL009W-A MRX1P40050 688 aa2.58□□□□□ -2
YHL009W-AYHL009W-A YIL060WP40519 144 aa2.58□□□□□ -2
YHL009W-AYHL009W-A SWP82P43554 623 aa2.58□□□□□ -2
YHL009W-AYHL009W-A RTT101P47050 842 aa2.58□□□□□ -2
YHL009W-AYHL009W-A CRN1Q06440 651 aa2.58□□□□□ -2
YHL009W-AYHL009W-A SWT1Q12104 458 aa2.58□□□□□ -2
YHL009W-AYHL009W-A ATP2P00830 511 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
YHL009W-AYHL009W-A APA1P16550 321 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
YHL009W-AYHL009W-A PTP2P29461 750 aa2.57□□□□□ -2
YHL009W-AYHL009W-A MSN2P33748 704 aa2.57□□□□□ -2
YHL009W-AYHL009W-A YER130CP39959 443 aa2.57□□□□□ -2
YHL009W-AYHL009W-A CTK2P46962 323 aa2.57□□□□□ -2
YHL009W-AYHL009W-A TRS130Q03660 1102 aa2.57□□□□□ -2
YHL009W-AYHL009W-A CIA1Q05583 330 aa2.57□□□□□ -2
YHL009W-AYHL009W-A NTR2P36118 322 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
YHL009W-AYHL009W-A SPC34P36131 295 aa2.56□□□□□ -2
YHL009W-AYHL009W-A TIF5P38431 405 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
YHL009W-AYHL009W-A RPR2P40571 144 aa2.56□□□□□ -2
YHL009W-AYHL009W-A RPM2Q02773 1202 aa2.56□□□□□ -2
YHL009W-AYHL009W-A ERP1Q05359 219 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
YHL009W-AYHL009W-A FMP45Q07651 309 aa2.56□□□□□ -2
YHL009W-AYHL009W-A COX17Q12287 69 aa2.56□□□□□ -2
YHL009W-AYHL009W-A ACH1P32316 526 aa2.55□□□□□ -2
YHL009W-AYHL009W-A SOF1P33750 489 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
YHL009W-AYHL009W-A TOM20P35180 183 aa2.55□□□□□ -2
YHL009W-AYHL009W-A PHD1P36093 366 aa2.55□□□□□ -2
YHL009W-AYHL009W-A ARP1P38696 384 aa2.55□□□□□ -2
YHL009W-AYHL009W-A PHO90P39535 881 aa2.55□□□□□ -2
YHL009W-AYHL009W-A ARC35P53731 342 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
YHL009W-AYHL009W-A YNR061CP53747 219 aa2.55□□□□□ -2
YHL009W-AYHL009W-A TMC1Q08422 150 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
YHL009W-AYHL009W-A TMA16Q08687 178 aa2.55□□□□□ -2
YHL009W-AYHL009W-A MTF1P14908 341 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
YHL009W-AYHL009W-A MCM4P30665 933 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
YHL009W-AYHL009W-A NDC1P32500 655 aa2.54□□□□□ -2
YHL009W-AYHL009W-A GRX7P38068 203 aa2.54□□□□□ -2
YHL009W-AYHL009W-A YFR020WP43600 232 aa2.54□□□□□ -2
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